ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Строение и структура протеинов из "ЯМР в медицине и биологии структура молекул, топография, спектроскопия in-vivo" Значения рК цистеипа и аргинина в свободных аминокислотах [3.1]. Другие значения рК для аминокислотного остатка X были измерены в модельном пептиде С1у-С1у-Х-А1а методом ЯМР [3.2]. Значения рК, приведенные в скобках, соответствуют наиболее вероятным значениям в протеине [3.3]. [c.98] ОСНОВНОЙ цепи обозначаются буквами р и СО, а диэдральный угол в боковой цепи обозначается (рис. 3.3), где / обозначает положение в боковой цепи. [c.100] Обозначения приведены согласно [3.4] и [3.6]. [c.102] СГ-спираль, 7Г-спираль, Зю-спираль и коллагеновая спираль (табл.3.2). Вследствие стерических препятствий в пептидной цепочке не все комбинации диэдральных углов будут равноправны, а соответствующие энергии могут существенно различаться. Комбинации углов (ри. р, соответствующие низким значениям потенциальной энергии, рассматриваются как разрешенные конформации, а конформации, соответствующие высоким значениям энергии, - как запрещенные. В простейшей модели, в которой атомы рассматриваются как твердые шарики, существование конформаций с различными возможными энергиями вполне очевидно некоторые комбинации диэдральных углов просто невозможно реализовать по стерическим причинам. Наглядно эти комбинации можно представить, воспользовавшись моделью Рамачандрана, в которой каждому диэдральному углу соответствует ось и обозначаются разрешенные и запрещенные области. [c.102] Вернуться к основной статье