ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Количественные закономерности специфических взаимодействий биополимер -лиганд из "Биологическая химия" В дальнейшем для единообразия в написании соотношений будем использовать вторую форму записи. При этом надо иметь в виду, что для гетерогенной системы понятия концентрации биополимера и комплекса PL имеют условный характер, представляя собой отношение их количества в образце к объему исследуемой пробы. [c.118] Если речь идет о каком-либо функционально значимом узнавании, то образование комплекса не является самоцелью, но лишь сигналом к последуюш,ему действию — ответу системы. Так, узнавание ферментом субстрата приводит к превращению субстрата в продукт реакции, узнавание гормона рецептором — к возникновению определенных внутриклеточных процессов. Чаще всего именно этот ответ и является объектом регистрации. Но в ряде случаев может регистрироваться и само образование комплекса, если, например, используется лиганд, содержащий высокорадиоактивную метку, и комплекс может быть отделен от избытка лиганда за время, исключающее заметную диссоциацию комплекса. Если же измеряется какой-либо химический или биологический ответ на узнавание, то резонно предполагать, что по крайней мере в первом приближении величина, характеризующая этот ответ (например, скорость ферментативной реакции), пропорциональна количеству образовавшегося комплекса. [c.118] Предельное значение ответа Д, ах соответствует полному насыщению биополимера лигандом. Половина от предельного значения достигается при концентрации лиганда, равной 1/А а, т.е. при концентрации, равной константе диссоциации комплекса биополимер — лиганд (рис. 39). [c.119] Частным случаем этого выражения является уравнение для скорости реакции превращения лиганда Ь1, катализируемого ферментом Р в присутствии второго лиганда Ьг, которое в несколько измененных обозначениях приведено и проанализировано в 6.3. [c.121] Если присутствие лиганда Ь2 тормозит ответ, вызываемый взаимодействием лиганда Ь] с биополимером Р, то Ьг называют ингибитором этого взаимодействия. Если Ь] является физиологически активным веществом, вызывающим определенный ответ на уровне живого организма, то согласно терминологии, принятой в фармакологии, L2 выступает в роли антагониста по 0т1юшению к Ь]. [c.121] Второй важный случай кооперативных взаимодействий проявляется в системах, построенных из нескольких субъединиц, содержащих однотипные центры связывания лиганда Ь. В качестве детально изученного примера можно привести уже неоднократно упоминавшийся гемоглобин, содержащий четыре остатка гема, по одному на каждой из двух а- и двух /3-субъединиц, и тем самым способный связывать до четырех молекул Ог- Важной особенностью этой структуры является тот факт, что присоединение О2 к одной из субъединиц вызывает конформационное изменение не только в ней самой, но и в контактирующих с ней субъединицах, причем в результате этих изменений повышается их сродство к кислороду. Это существенно изменяет вид зависимости степени насыщения кислородом от его парциального давления по сравнению с гиперболической зависимостью, описываемой уравнением (3.12). Важно, что при этом зависимость становится значительно более благоприят1Юй для выполнеш я гемоглобином его основной биологической функции — переноса кислорода от легких к тканям живого организма. [c.121] Согласно этому выражению зависимость ответа от концентрации лиганда в координатах lg Д/(Л — Л) , lg[L] должна быть линейной, причем тангенс угла наклона ее должен быть равен п. Поскольку модель является упрощенной, то и реальная зависимость, получаемая из эксперимента, как правило, не является линейной. Однако средний наклон этой зависимости в извест1юй мере дает представление о степени кооперативности рассматриваемой системы. [c.123] Такой подход может быть без труда распространен на биополимеры с произвольным числом субъединиц, но при этом будет соответственно возрастать число параметров, необходимых для описания равновесия и величины ответа. Это затрудняет использование такого строгого подхода для систем с большим числом субъединиц, а в некоторых случая.ч практически полностью его обесценивает. [c.124] Вернуться к основной статье