ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Изменение размеров полипептидных цепей при переходе спираль — клубок из "Конформации макромолекул" МЫ приписываем свободную энергию инициирования спирального участка цепи / иниц поровну двум мономерным единицам в начале такого участка, имеющим жесткую спиральную-конформацию, но не связанным водородной связью с предшествующими единицами. [c.321] Суммирование производится по всевозможным наборам [г , где 8 = О, 1. Множители 5 и о по-прежнему определяются формулами (9.9) и (9.10). [c.321] Как видно, элементы матриц при физическом (формула (9.13)) и геометрическом (формула (9.58)) подходах различаются. Однако их вековые уравнения совпадают, что естественно, так как оба подхода должны давать полностью эквивалентные результаты, а все физические свойства системы определяются корнями векового уравнения. [c.322] И в этом случае, как и ранее (см. 24), рассмотрение может быть упрощено, если пренебречь невозможностью существования менее чем трех мономерных единиц в спиральной конформации, как это было сделано Лифсоном и Рой-гом [30]. Тогда взаимосвязанными оказываются только конформации трех последовательных мономерных единиц, и матрица О оказывается матрицей четвертого порядка, которая может быть преобразована далее в матрицу третьего порядка. Получаемые при этом результаты [ ] матю отличаются от результатов, полученных путем рассмотрения точной статистической суммы (9.57). [c.322] Здесь — средняя доля спиральных мономерных единиц в молекуле, определяемая формулой (9.59), — средняя доля мономерных единиц, связанных водородной связью, определяемая формулой (9.15), — максимальный корень уравнения (9.14) и 5 — константа равновесия для образования водородной связи в мономерной единице, следующей за связанной единицей (формула (9.9)). [c.324] При малых значениях параметра кооперативности а, в частности при а 2 10 , определенном, как указывалось выше, путем сравнения теории с экспериментальными данными по поли-7-бензил-1-глутамату [23,33] результаты приближенной теории практически совпадают с результатами более строгой теории Нагаи, учитывающей реальную структуру клубкообразных частков цепи. Это связано с тем обстоятельствсм, что применимость второй, приближенной, модели тем лучше, чем больше среднее число мономерных единиц в клубкообразном участке. Как было показано ранее (см. (9.28)), в области перехода это число по порядку величины равно 1/]/а, т. е. для а 2 10 достаточно велико. [c.324] Вернуться к основной статье