ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Факторы, влияющие на тепловую денатурацию из "Органическая химия нуклеиновых кислот" Нуклеотидный состав. Температура плавления двухспиральных полинуклеотидов зависит также от их состава. С увеличением содержания пар гуанин цитозин Гщ двухспиральных молекул линейно увеличивается 145,212,343-347 как показано на рис. 4.18 (ср. с данными о стабильности пар оснований, стр. 225). В качестве модели для установления зависимости Гт полинуклеотида от состава оснований можно использовать синтетические олигонуклеотиды. При наличии возможности образования трех водородных связей на пару оснований температура плавления соответствующих двухспиральных полинуклеотидов повышается. Тем не менее число водородных связей на пару оснований само по себе не определяет однозначно Тщ двухспирального полинуклеотида. Так, для двухспирального комплекса поли-2-аминоаденило-вой кислоты с полиуридиловой кислотой Гщ значительно ниже, чем для двухспирального комплекса полицитидиловой кислоты с полигуаниловой кислотой, хотя число водородных связей у них одинаково Этот эффект уже был отмечен при взаимодействии мономерных компонентов нуклеиновых кислот (см. стр. 227). [c.265] В полирибонуклеотиде, что приводит к усилению мен плоскостных взаимодействий вследствие уменьшения свободы вращения основания вокруг гликозидной связи (см. стр. 142). Однако такое объяснение нельзя считать единственным. Различие в стабильности двухспиральных комплексов может быть связано с взаимодей-ствиялги с растворителем или с изменением конформации кольца углеводного остатка. [c.266] Возможность существования двухспиральной молекулы ДНК как целого со значительными нарушениями внутри двойной спирали следует из опытов по денатурации ДНК путем нагревания Б присутствии формальдегида 79-181 На электронных микрофотографиях обработанной таким образом ДНК обнаруживаются локально денатурированные участки, относительное содержание нуклеотидов в которых увеличивается с повышением температуры или увеличением продолжительности обработки формальдегидом. Распределение таких участков не случайно, а соответствует всегда определенным местам молекулы. Можно полагать, что это участки, богатые парами аденин тимин. По мере повышения температуры размеры таких участков увеличиваются, они сливаются, и конечным результатом является разделение комплеД1ентарных цепей. Следует отметить, что денатурация в присутствии формальдегида отличается от обычной тепловой денатурации, поскольку она сопровождается химическим взаимодействием с формальдегидом, так что ренатурация областей, содержащих модифицированные звенья, невозможна. В результате этого при каждой данной температуре — а не только при температуре плавления — конечным итогом денатурации является разделение цепей Поэтому на основании опытов с использованием формальдегида для фиксации частично денатурированных областей в молекулах ДНК в интервале плавления нельзя делать выводов об истинных размерах и распределении этих областей при данной температуре в отсутствие формальдегида. [c.268] Вернуться к основной статье