Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English
Во многих методах минимизации для обнаружения ближайшего энергетического минимума используются наклоны поверхности потенциальной энергии в области допускаемой пробной структуры. Эти наклоны определяются набором частных производных L d ld%. Если параметры, определяющие энергетические члены (ван-дерваальсовская энергия), 8 q и Г,, т. е. межатомные расстояния, углы поворота, валентные углы и длины связей, могут быть выражены как простые функции параметров используемых для определения геометрии, градиент энергии можно определить непосредственно дифференцированием. Это возможно только для простых систем типа этана, в которых изменения геометрии молекулы можно задать одним углом поворота. Однако в большинстве систем энергетические параметры взаимосвязаны и непосредственное дифференцирование выполнимо только в случае упрощающих допущений относительно связи между геометрическими и энергетическими параметрами. Обычно приближения такого типа будут обоснованны только для ограниченного ряда структур, сконцентрированных около пробной структуры.

ПОИСК





Методы вычисления конформационных энергий

из "Абсолютная конфигурация комплексов металлов"

Во многих методах минимизации для обнаружения ближайшего энергетического минимума используются наклоны поверхности потенциальной энергии в области допускаемой пробной структуры. Эти наклоны определяются набором частных производных L d ld%. Если параметры, определяющие энергетические члены (ван-дерваальсовская энергия), 8 q и Г,, т. е. межатомные расстояния, углы поворота, валентные углы и длины связей, могут быть выражены как простые функции параметров используемых для определения геометрии, градиент энергии можно определить непосредственно дифференцированием. Это возможно только для простых систем типа этана, в которых изменения геометрии молекулы можно задать одним углом поворота. Однако в большинстве систем энергетические параметры взаимосвязаны и непосредственное дифференцирование выполнимо только в случае упрощающих допущений относительно связи между геометрическими и энергетическими параметрами. Обычно приближения такого типа будут обоснованны только для ограниченного ряда структур, сконцентрированных около пробной структуры. [c.90]
Этот метод не требует никаких предварительных приближений, и точность наклона зависит только от величины приращения параметра Д ,-. [c.91]
Эффективность метода приращений ограничена числом геометрических параметров, которые влияют на минимизацию конформационной энергии. Если геометрия молекулы определяется просто декартовыми координатами N атомов, существует 2 N геометрических переменных, которые могут потребоваться для минимизации. Виберг [135] и другие авторы для исследований, в которых требовались только малые искажения пробных структур, использовали в качестве переменных декартовы координаты. Однако в расчетах, обсуждаемых ниже, пробные структуры задаются набором внутренних координат. Это понижает максимальное число переменных с ЗЛ до 3yV —6, а также позволяет рассмотреть большое число конформаций в ходе одного исследования. Кроме того, внутренние координаты могут быть выбраны так, чтобы большинство из них были инвариантными или по крайней мере ограничивалось очень узкими пределами значений. [c.92]
Для систем, содержащих много важных переменных, метод первоначального сканирования представляется довольно громоздким строго он применялся только к относительно простым системам, например к изолированным этилендиаминовому и 1,3-диаминопропановому хелат-ным кольцам [48]. Однако если известны основные свойства изолированного хелатного кольца, можно сделать много упрощений в рассмотрении содержащего его октаэдрического комплекса, так как сканирование энергетической поверхности обнаруживает возможные виды искажения кольца. В частности, можно использовать энергетическую поверхность изолированного кольца для подбора пробных структур и параметров переменных для минимизации энергии в содержащих его moho-, бис- и /прис-комплексах. [c.92]


Вернуться к основной статье


© 2025 chem21.info Реклама на сайте