ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Конформации синтетических и природных полинуклеотиСтруктурные единицы нуклеиновых кислот из "Конфирмации органических молекул" В этой главе рассмотрены три аспекта конформаций синтетических и природных полинуклеотидов (нуклеиновых кислот) 1) выявление строения наименьших структурных элементов и роль их в определении конформации макромолекулы 2) выявление конформаций однотяжевых полинуклеотидов и условий, влияющих на изменение этих конформаций 3) структурные данные по двухтяжевым полинуклеотидам и возможность их теоретической интерпретации. [c.400] Разумеется, пока мы имеем дело с мононуклеотидами и нукле-озидами, содержащими одно основание, этот эффект не проявляется, и их конформации определяются взаимным отталкиванием и притяжением валентно не связанных атомов молекулы. В этом случае влиянием растворителя можно пренебречь. [c.401] В чем же отличие полинуклеотидов от обычных полимеров и полипептидов Прежде всего, гидрофобные силы, которые в последних начинают проявляться при сравнительно большой длине цепи, когда могут образоваться внутренние и внешние области, уже в динуклеотидах дают значительный вклад в стэкинг-взаимодействия, который, как мы увидим, практически не увеличивается с ростом длины цепи. Далее, решающую роль в определении конформации полинуклеотида играют взаимодействия ближайших мономерных единиц, а взаимодействия более далеких единиц можно считать пренебрежимо малылпг. Поэтому, например, рассмотрение динуклеозидфосфатов раскрывает основные конформационные особенности однотяжевых полинуклеотидов. [c.401] В этом смысле мононуклеотиды и динуклеотнды резко различаются конформационная свобода первых очень велика благодаря возможности вращения вокруг пяти одинарных связей рибо-зофосфатного скелета и гликозидной связи между основанием к фуранозным кольцом в то же время в динуклеотидах конформационная свобода ограничена из-за стремления оснований расположиться одно под другим. По этой причине рассмотрение возможных конформаций наименьших структурных единиц полинуклеотидов (фрагментов, не превышающих по величине мононуклеотид) еще не приводит к полному пониманию конформаций макромолекул. [c.401] Конформация мономерной единицы определяется геометрией фуранозного кольца, структурой основания, фосфатной группы и, наконец, относительным положением основания и пятичленного кольца. [c.402] Вернуться к основной статье