ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы Конформации мономерной единицы полинуклеотидной цепи из "Конфирмации органических молекул" Для нахождения разрешенных конформаций каждое вращение представляется матрицей, и координаты атомов ротаметра вычисляются по методике, описанной в разделе 5 гл. 2. Включение в расчет атомов водорода оказывает заметное влияние на разрешенные области. В то же время существенно, что введение пуринового или пиримидинового основания практически не изменяет конформационной свободы фрагментов, откуда следует независи.мость углов вращения в рибозофосфатном скелете и угла (или х)-Возможные конформации характеризуются следующим набором торсионных углов 0 около 180 , около 60°, 180° и 300°, со в пределах от 210° до 260°. [c.410] В регулярном однотяжевом полимере (напри.мер, поли-А) ри-бознофосфатный стержень содержит уже пять независимых параметров, т. е. в дополнение к рассмотренным выше углам необхо-димо включить еще ср и г . Углы ф и я ) появляются только в дину клеозидфосфатах, и по этой причине разрешенные конформации макромолекулы могут быть найдены из рассмотрения динуклеозидфосфатов (с аналогичной ситуацией мы встречаемся при исследовании олиго- и полипептидов — все основные закономерности следуют из анализа конформационных карт дипептидов). [c.410] в отличне от пептидных производных, двумерные кон-формацпонные карты которых позволяют найти положение и форму минимумов мономерной единицы, при решении подобных задач для производных нуклеотидов мы сразу же сталкиваемся с проблемой многих минимумов, и реш ение ее, вероятно, будет не просто. [c.411] Вернуться к основной статье