Октануклеотид

Пики 6, 5, 4 и 3 отвечают продуктам последовательной деградации октануклеотида. При шелечном гидролизе каждого из них образуется только один нуклеозид - соответственно гуанозин, аденозин, гуанозин и аденозин. Так как было известно, что октануклеотид содержит два Ар, пять Gp и оцин Up, причем Up находится на 3 -конце -а оцин Gp- [c.109]

Т аб лица 6.3 Ступенчатая деградация октануклеотида из РНК фага f2 [c.121]

Применяя этот принцип, Корана синтезировал тетрануклеотиды. Из двух защищенных тетрануклеотидов был получен октануклеотид, из него и тетрануклеотида — додекануклеотид и, наконец, из додекануклеотида и тетрануклеотида — гексадекануклеотид. Получены и другие олигонуклеотиды. [c.734]

Был осуществлен синтез тимидиновых олигонуклеотидов (тетра-, гекса- и октануклеотидов) путем ступенчатого присоединения защищенного динуклеотидного блока [c.402]

Оказалось, что при использовании в качестве активирующего агента хлорангидридов ароматических сульфокислот выход тетрануклеотида повысился до 65—80%, гексануклеотида — до 38—57%, октануклеотида — до 24—38%. Достигнутые успехи позволили распространить данный метод на синтез более длинных полидезоксирибонуклеотидов со специфической тетрануклеотидной последовательностью (1-(ТрАрСрТ). Для этой цели используют защищенные тетрануклеотидные блоки. Например, синтез гексадекануклеотида осуществлен по схеме [c.402]

В системе, катализируемой этими ферментами, происходит как образование новой фосфодиэфирной связи, так и спаривание комплементарных цепей. Например, при помощи данной ферментной системы в присутствии комплементарного d-(TpTpAp p)4 соединены конец в конец две молекулы октануклеотида d-(ApApTpGp)2 с образованием соответствующего гексадекануклеотида [c.448]

Укороченный вариант синтезированной ln vivo РНК фага Q тоже имеет на 5 -конце указанную октануклеотид-ную последовательность. Синтезированная in vivo РНК фага Q имеет на конце Ц, а не приведенную выше последовательность [40]. [c.100]

Рис. 13.1. Реконструирование нуклеотидной последовательности с помощью метода секвенирования ДНК посредством гибридизации А - отдельные ячейки олигонуклеотидной матрицы, содержащие различные октануклеотиды (подчеркивание символизирует их фиксацию на подложке), с произошедшей там гибридизацией с исследуемым фрагментом ДНК (вертикальные черточки изображают связи между комплементарными олигонуклеотидами, выделенными жирным шрифтом) Б - реконструированная часть нуклеотидной последовательности секвенируемого

Обнаруженный эффект увеличения температуры диссоциации дуплексов на 5°С при трехкратном увеличении их концентрации в матриксе, представленном полиакриламидным гелем, был использован Мирзабековым и соавт. для выравнивания температур плавления октануклеотидов с разными G -составом, что необходимо для лучшей идентификации совершенных и несовершенных дуплексов [Храпко и др., 1991 Khrapko et al., 1991]. Так, одним из тонких мест данного метода секвенирования ДНК является как раз детекция только совершенных дуплексов, не содержащих неспаренных нуклеотидов, поскольку в противном случае будет внесена ошибка, делающая дальнейшую реконструкцию ДНК или невозможной или неправильной. Считается, что наибольшие трудности подстерегают экспериментатора при выявлении несовершенных дуплексов в случае наличия в них терминальных неспаренных нуклеотидов и, в частности, пар G T и G A [Mirzabekov, 1994]. [c.407]

Среди рестриктаз обсуждаемой группы особенно выделяется последовательность нуклеотидов, узнаваемая рестриктазой Sfi I [301] (табл. 8, тип 17). Она представляет собой октануклеотид, разделенный 5-тью любыми основаниями 5 -GG (N)sGG . Это самая протяженная последовательность среди всех идентифицированных участков, узнаваемых специфическими эндонуклеазами. [c.39]

Грин с соавт. [106] для определения активности этого же фермента, наряду с ДНК вируса ОВ40, в качестве субстрата использовали синтетический октануклеотид, меченный содержащий участок, узнаваемый этим ферментом. Измерение содержания метки в продуктах реакции, разделенных методом электрофореза на бумаге, позволило количественно оценивать активность исследуемого фермента. [c.128]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология