ПОИСК Статьи Рисунки Таблицы ка молекулы воды. Отметим, что на таких разностных картах, рассчитанных без учета фазового состояния молекул воды, последняя дает пик половинной высоты [9]. Тщательное изучение этих «безфазовых» разностных карт позволяет получить много дополнительной информации, так как карты содержат мало смещений (погрешностей). В то же время фазовые карты, как правило, воспроизводят особенности структуры даже в том случае, если они не дают никакого вклада в значение структурного фактора, т. е. если молекулы воды введены в набор фаз, то они приводят к появлению дополнительных особенностей на картах Фурье, которые отсутствуют на картах белка. Ориентацию молекул DgO проверяли с помощью графиков, начерченных самим компьютером [10]. Двум дейтронам и атому кислорода приписывали положение, где наблюдалось наилучшее соответствие разности плотности нейтронов, в предположении, что D2O имеет идеальную геометрию. Это допускало возможность приспособления доноров и акцепторов с О-нолосой на поверхности белков. Степень заселенности пространства молекулами воды определяли по программе метода реального пространства из разностной карты. Нейтронная плотность молекулы D2O при 100%-ной степени заселенности на «безфазовой» разностной карте должна быть 0,96-10 ’2 см, а ошибка расчета этих разностных карт равна только 0,1-10" 2 см. Действительная высота пика, однако, снижается под действием температурных факторов вследствие того, что D2O составляет лишь около 80% кристаллизационной воды, на что указывают результаты анализа методом ЯМР [II] кристалла МЬ—СО (pH 5,6 в 80%-ном растворе сульфата аммония). Изучение и анализ разностной карты кристалла МЬ—СО позволили установить, что на асимметрическую единицу (молекулу миоглобина) приходится 40 молекул воды. В число этих пиков не включали ни одного пика с относительным весом менее 0,4 молекулы воды. На остальной части разностной карты можно обнаружить некоторые особенности молекул воды, но при низком уровне заселенности (<0,4). Выяснение расположения и относительного веса молекул воды было выполнено в ходе двух циклов уточнения по методу реального пространства, и это привело к уменьшению среднеквадратичного отклонения до