Первый раунд ПЦР. ДНК-мишень фланкирована последовательностями Г—2 в одной цепи и последовательностями 1—2 — в другой. К образцу ДНК добавляют праймеры . Смесь нагревают до 95 С, инкубируют в течение 1 мин и медленно охлаждают до 55 С. При этой температуре праймеры, добавленные в избытке, спариваются с разделенными цепями. Повышают температуру до 75 С. В этих условиях происходит синтез обеих цепей ДНК, начинаюший-ся с 3 -гидроксильных концов праймеров. Каждая из синтезированных цепей имеет гораздо большую длину, чем расстояние от 3 -гидроксильной группы ее праймера до концевого нуклеотида последовательности, комплементарной второму праймеру. Эти цепи служат матрицами во втором раунде ПЦР.