В функционировании С4-цикла в листе участвуют фотосинтезирующие клетки двух типов. Поэтому должны существовать механизмы, позволяющие переносить метаболиты из клетки в клетку и через оболочку хлоропласта . Роль хлоропластов в С4-фотосинтезе можио изучать, выделяя эти органеллы нз клетки. Координация обмена веществ и в тех и в других клетках не ограничивается С4- и ВПФ-цикламп оиа включает также синтез сахарозы, крахмала и обмен аминного азота.