Пролинрацемаза

Если за счет энергии связывания происходит искажение субстрата в состояние, напоминающее переходное, то это эквивалентно утверждению, что переходное состояние связывается с активным центром более эффективно, чем субстрат. Поэтому соединения, которые являются аналогами переходного состояния, также должны связываться с ферментом более эффективно, чем субстрат. Существует несколько свидетельств, что это может иметь место. Пролинрацемаза ингибируется пиррол-2-карбоновой кислотой (V) в концентрациях, в 160 раз меньших, чем пролином (VI). Фуран-2-карбоновая кислота (VII) и тиофен-2-карбоновая кислота (VIII) [c.236]

Деформация и напряжение в ферментах могут вызываться различными причинами. Как мы видели в данной главе и увидим ниже (гл. 12), деформация и напряжение включают два процесса дестабилизацию субстрата и стабилизацию переходного состояния. Дестабилизация субстрата может сопровождаться пространственной деформацией, когда между ферментом и субстратом возникают неблагоприятные взаимодействия (пролинрацемаза, лизоцим), десольватацией фермента (удаление двух молекул воды от карбоксильной группы Asp-52 в лизоциме), десольватацией субстрата (например, пептида, теряющего ка-кое-то количество молекул связанной воды). Стабилизация переходного состояния сопровождается возникновением таких типов связывания, которые отсутствуют в случае субстрата (сериновые протеазы, цитидиндезаминазы), ослаблением пространственной деформации, повторной сольватацией фермента или субстрата (или образованием электростатических связей) в переходном состоянии. [c.324]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология