Геномы фага лямбда

В связи с новыми представлениями о функциональной организации ДНК, перед радиобиологией неизбежно возникает задача дифференцирования поражаемости отдельных функций, связанных с ДНК. Мы предприняли попытку найти подход к решению этой сложной задачи, который основывается на функциональной организации ДНК умеренного фага лямбда. Функциональная организация генома фага лямбда является наиболее простым отражением строения (по функциональным признакам) ДНК, входящей в состав генетических структур клеток. [c.168]

Рис. 16.6. Карта генома фага лямбда. Видно, что гены с родственными функциями сгруппированы в кластеры. Геном содержит около 46 500 пар оснований.

И. Включение генома фага лямбда в геном Е. соИ катализируется [c.29]

Концы генома фага лямбда маркированы последовательностями, получившими название со5-сайтов. По левому (согласно обычной карте фага) со5-сайту происходит расщепление и образуется свободный конец, который внедряется в капсид. Внедрение ДНК продолжается вплоть до второго со5-сайта, который также отщепляется, образуя второй конег( молекулы-генома. Тот конец, который при сборке входит в капсид последним, первым проникает в новую клетку-хозяина. [c.345]

Подобный подход к генетическим текстам активно используется в лингвистике ДНК, при этом набор неожиданно часто (или редко) встречающихся слов был назван словарем генетического текста. Для построения словарей генетических текстов необходимо уметь отвечать на вопрос, какие отклонения частот встречаемости слов от ожидаемых значений следует считать значимыми. Например, если слово TGATG 133 раза встретилось в геноме фага лямбда - много это или, наоборот, мало [c.37]

В работе Певзнера и др. (Pevzner et al.,1989b) была предпринята попытка компьютерного анализа зонной структуры генома фага лямбда и интерпретации ее в рамках модульной гипотезы. При этом предполагалось, что модули, имеющие разное происхождение, должны быть по-разному устроены статистически. Конечно, эти статистические различия могут оказаться довольно тонкими и не выявляться на уровне примитивного сравнения A,T,G, составов - ведь все модули одного генома испытывали уже в составе этого генома продолжительное эволюционное давление, которое могло привести к сглаживанию исходных различий. Поэтому при статистическом анализе использовалось различие частот встречаемости стационарных 1-грамм, которые были введены в предыдущем разделе. [c.63]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология