Сайты рестрикции частота встречаемости

По данным сиквенса одной нити программы строят комплементарную нить, подсчитывают состав оснований, вьщеляют области, богатые ОС- или АТ-парами, представляют частоты встречаемости различных динуклеотидов, дают информацию о локализации специфических сайтов и т. д. Программы отыскивают прямые и инвертированные повторы в ДНК, причем можно задать степень негомологичности и длину стебля шпильки. Нетривиальные повторы могут служить регуляторными сайтами, образуя совместно с регуляторными белками и вспомогательными факторами характерные структуры в самой ДНК или в РНК-транскрипте. Анализ на наличие и локализацию сайтов рестрикции, информация о числе и размере рестриктов, образуемых действием одной несколькими рестриктазами, позволяют планировать эксперименты по клонированию определенных участков геномной ДНК. При этом программы учитывают форму ДНК (линейная или кольцевая). [c.470]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология