Локализация специфических олигонуклеотидов

Локализация специфических олигонуклеотидов [c.194]

Особый интерес представляют, конечно, взаимодействия рибосомных белков с высокополимерными рибосомными РНК (16S и 23S РНК прокариот или 18S и 28S РНК эукариот), ибо они представляют собой основной ковалентный каркас и структурное ядро рибосомных субчастиц. По-видимому, больщинство рибосомных белков контактируют и так или иначе взаимодействуют с высокополимерными рибосомными РНК. Однако среди них можно выделить специальные сердцевинные РНК-связывающие белки, которые прочно взаимодействуют с соответствующей рибосомной РНК, более или менее независимо от других белков. Такими белками малой (30S) рибосомной субчастицы Е. соИ, независимо вступающими в комплекс с 16S РНК, являются S4, S7, S8, S15, S17 и S20. Каждый из них связывается только со специфическим местом на 16S РНК, узнавая его нуклеотидную последовательность и пространственную структуру. Эту последовательность можно выявить таким путем изолированный белок добавляется к рибосомной РНК, в результате чего образуется специфический белок-РНК-комплекс комплекс переваривается рибонуклеазой, так что негидролизованной остается лищь та часть нуклеотидной последовательности, которая закрыта белком эта защищенная последовательность определяется и, таким образом, идентифицируется. Другой метод локализации белков на первичной структуре рибосомной РНК — ковалентная сщивка (например, фотоиндуци-рованная) белка с РНК непосредственно в составе рибосомы, с последующим удалением несшитых белков, перевариванием РНК с помощью РНКазы и идентификацией сшитого олигонуклеотида. Расположение мест связывания вышеуказанных шести белков вдоль цепи 16S РНК схематически показано на рис. 59, а. Видно, что белки [c.100]

Подавляющее большинство химических связей между ФАВ и полимером-носителем специфически гидролизуется ферментами. Эта специфичность была использована для отщепления действующего начала в заранее заданном месте организма [42]. Разный набор ферментов в разных местах позволяет выделить среди них специфичные именно для клеток данной локализации. Наиболее широкий набор гидролитических ферментов имеется в лизосомах протеазы, нуклеазы, гликозидазы. Таким образом, чтобы добиться биодеструктируемости, необходимо ввести в нужное место карбоцепного полимера — в главнун> цепь или во вставку — фрагменты пептидов, олигосахаридов или олигонуклеотидов, которые были бы субстратами упомянутых ферментов и могли бы расщепляться ими [43]. Такие карбоцепные сополимеры были синтезированы на основе Н-(2-гидроксипропил)метакриламида (2.3). Они содержат боко- [c.59]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология