Репрессор С и концевые фрагменты

Под действием трипсина репрессор разрезается преимущественно по положению 59. С-концевой фрагмент белка, содержащий аминокислотные остатки 60-360, называют ядром , резистентным к трипсину. Он сохраняет способность собираться в тетрамер и связываться с индуктором однако он не обладает способностью присоединяться к оператору. N-концевой фрагмент, содержащий аминокислотные остатки 1-59, называют длинным N-концевым фрагментом. Он в свою очередь может быть [c.184]

Каждый домен способен выполнять свою функцию независимо от другого. С-концевой протеолитический фрагмент способен образовывать олигомеры. N-концевой фрагмент способен связаться с операторами, хотя и с более низкой эффективностью, чем интактный репрессор. Таким образом, информация для специфически контактирующей ДНК содержится в пределах N-концевого домена, но (так же как в случае с /ас-репрессором) эффективность процесса повышается при присоединении С-конце-вого домена. Вероятно, это происходит из-за способности интактного репрессора димеризоваться, что обеспечивает одновременное связывание с ДНК его двух N-концевых доменов. Выделенная N-концевая область осуществляет те же контакты с ДНК, как и интактный репрессор. Однако при удалении последних трех N-концевых аминокислот способность к некоторым из контактов утрачивается. На основе этого наблюдения была предложена модель, показанная на рис. 16.9, согласно которой основная часть N-концевой области осуществляет контакты на одной стороне ДНК, тогда как три последние N-концевые аминокислоты образуют контакты на противоположной стороне ДНК. [c.214]

При повышении температуры белки или их домены переходят в неупорядоченное состояние (денатурируют), причем каждый домен обладает своей собственной характерной температурой денатурации. Если измерять температуру денатурации для каждого из доменов по отдельности, то окажется, что N-концевой фрагмент репрессора денатурирует при температуре примерно на 20°С ниже, чем С-концевой (рис. 4.9). [c.94]

Если N-концевой участок является ответвлением, способным связываться с ДНК, какова функция тетрамерной структуры и как она контактирует с ДНК Согласно одной из моделей, предполагается, что репрессор имеет форму удлиненной гантели или цилиндра длиной примерно 115 А, ось которой может пересекаться с осью ДНК, образуя небольщой угол, равный 15-20°. Ядра всех четырех субъединиц контактируют своими центральными областями N-концевые участки связывания находятся по краям молекулы, располагаясь парами. Не исключено, что на самом деле только две из четырех субъединиц контактируют с ДНК, оставляя два других участка связывания с ДНК незанятыми. Хотя ядро субъединицы не узнает операторного участка, оно все же способно связываться с ДНК неспецифически, так что, по-види-мому, оно также осуществляет контакты (хотя они не являются настолько, выраженными, чтобы оказывать влияние на характер защиты ДНК в той же мере, как это делает один N-концевой фрагмент). [c.185]

При обработке очищенного репрессора какой-либо про-теазой, например папаином, образуются два сравнительно устойчивых фрагмента (рис. 4.8). Анализ их аминокислотной последовательности показывает, что один из этих фрагментов происходит из N-концевой части репрессора (остатки 1-92), а другой-из С-концевой (остатки 132-236). [c.94]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология