Пары оснований угол наклона к оси спирали

Находятся ли природные ДНК в А-форме — неизвестно, но можно с достаточной определенностью сказать, что гибриды РНК — ДНК существуют в А-, а не в В-форме даже в обычных водных буферных растворах. С помощью рентгеноструктурного анализа было исследовано множество двойных спиралей РНК. Оказалось, что структурой, наилучщим образом согласующейся с экспериментальными данными, является спираль РНК-11. Она имеем 11 пар оснований на виток, а угол наклона плоскости пары оснований к плоскости, перпендикулярной оси спирали, составляет 13 — 14°. Тем не менее дифракционные данные, полученные при исследовании таких РНК, недостаточно полны и точны, чтобы исключить альтернативную спираль — РНК-10. Последняя имеет 10 пар оснований на виток, отклоняющихся на 10° от перпендикуляра к оси спирали. Структура РНК-10 занимает как бы промежуточное положение между А- и В-формами ДНК. [c.175]

Когда удалось построить более детальную модель комплекса этидия с ДНК, картина оказалась более сложной. На рнс. 23.30,5 представлена идеализированная структура комплекса этидия с В-ДНК в двух разных проекциях. Пары оснований, контактирующие с ин-теркалированным этидием, наклонены по отношению друг к другу. В результате возникает излом осн двойной спирали с углом 8°, еслн спираль В-ДНК распространяется по обе стороны от молекулы этидия. Кроме того, оси спиралей над и под молекулой этидия оказываются смещенными друг относительно друга примерно на 1 А, подобно тому. как это происходит в случае изломов, описанных в гл. 3. Из-за образования изломов полностью насыщенная этидием ДНК будет находиться в сверхспирализованном состоянии. Каждая интеркалировавшая молекула этидия приводит к раскручиванию В-спирали на угол 26°, что находится в согласии с результатами гидродинамических исследований связывания этидия с ДНК (гл. 24). [c.377]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология