Обнаружение отдельных генов и геномных последовательностей

Обнаружение отдельных генов и геномных последовательностей [c.256]

С обнаружением отдельных генов или специфических геномных последовательностей связаны прежде всего возможности анализа микробных сообществ без выделения и идентификации отдельных его членов в чистых культурах. Методы основаны на экстракции из почвенных, осадочных или водных образцов тотальной ДНК, ее очистки и анализа с помощью градиентных гель-элект-рофорезов — термического и денатурирующего (ТООЕ/ООСЕ). Основной трудностью при экстракции тотальной ДНК является ее отделение и очистка от гуминовых веществ почвы. Однако методы, позволяющие проводить такую очистку, постоянно совершенствуются. [c.256]

Все последовательности, расщепляемые рестриктазой Alu, по-видимому, являются членами одного семейства, названного (в соответствии со способом его обнаружения) Alu-семейством. На гаплоидный геном приходится примерно 300000 членов, входящих в его состав (это эквивалентно тому, что на каждые 6 т. п. н. ДНК приходится один его член). Отдельные Alu-последовательности щироко распространены в геноме по меньщей мере одна копия Alu-последовательности обнаруживается практически в каждом клоне библиотеки фрагментов геномной ДНК со средней длиной 18 т. п. н. Семейство аналогичных последовательностей обнаружено у мыщи (оно называется семейством В1 и в его состав входит 50000 членов), у китайского хомячка (где оно называется Alu-подобным семейством) и у других млекопитающих. [c.299]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология