Спирали с одноцепочечным стэкингом

Из гл. 5 известно, что мочевина увеличивает растворимость в водных растворах аминокислот с неполярными боковыми группами. Отсюда можно заключить, что она будет разрушать гидрофобные взаимодействия. Поэтому в той степени, в какой стэкинг оснований стабилизирован гидрофобными взаимодействиями, мочевина должна дестабилизировать стэкинг в одноцепочечных структурах и в двойных спиралях нуклеиновых кислот, чему имеются экспериментальные подтверждения. [c.321]

Вывод о том, что гомополимеры образуют одноцепочечную спираль со стэкингом оснований, позволяют сделать результаты исследования дифракции рентгеновских лучей от волокон. Таким методом была определена структура ро1у(С) (рис. 22.5). Оказалось, что полимер представляет собой одноцепочечную спираль и что между соседними основаниями существует стэкинг-взаимодействие. Отметим, однако, что структура полимера сильно отличается от структуры одной из цепей обычной двойной спирали РНК или ДНК. Poly(Q имеет шесть оснований на виток, в то время как в двойных спиралях их 10 или 11. [c.248]

Условия совместимости спиралей. Возможные элементы вторичной структуры РЖ представлены на рис.6.1. Двутяжевый спиральный участок, или для краткости спираль, состоит из нескольких комплементарных пар, в которых нуклеотиды образуют классические Уотсон - Криковские А-О и С-С связи, а также С-О связь.Наличие С-О связи было экспериментально установлено, правда, при этом нужно учитывать, что связь между этими нуклеотидами непрочная и пара 0-11 может находится только внутри спирали, стабилизируемая стэкинг взаимодействиями соседей. Одноцепочечные участки характеризуются тремя типами петель и свободами З и 5 концами цепи. [c.190]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология