ДНК одноцепочечная

Рис. 4-70. Измерение количества копий определенного гена в образце ДНК с помощью гибридизации ДНК Одноцепочечный радиоактивный фрагмент ДНК, используемый в таких экспериментах, называют ДНК-зондом. Хромосомная ДНК в данном случае не содержит радиоактивных

Геном большинства вирусов представлен или двухцепочечной ДНК, или одноцепочечной РНК, однако у некоторых мелких вирусов ДНК одноцепочечная, а другие содержат двухцепочечную РНК- Число нуклеотидов в вирусном геноме варьирует от нескольких тысяч до нескольких сотен тысяч, а число генов —от 3 до 200 и более. Иногда молекулы нуклеиновой кислоты в вирионе имеют форму замкнутого кольца, в других случаях они линейны. [c.286]

В процессе сайт-специфической рекомбинации в обмен вступают короткие специфические нуклеотидные последовательности одной и той же или обеих спиралей ДНК, распознаваемые особым сайт-специфическим ферментом, что приводит к трансформации распределения нуклеотидных последовательностей в геноме. Любые комплементарные взаимодействия между двумя гомологичными спиралями ДНК возможны лишь тогда, когда в одной из двух цепей происходит разрьш. К числу факторов, вызывающих такие одноцепочечные разрывы, относят химические агенты, некоторые виды излучения, специфические белки. Например, у Е. соИ обнаружен белок гес B D, который вызывает в молекулах ДНК одноцепочечные разрьшы. Белок гес B D представляет собой ДНК-зависимую АТРазу, которая действует как ДНК-хеликаза, перемещающаяся по спирали ДНК и вызывающая ее расплетение. Под влиянием этого белка, обладающего нуклеазной и хеликазной активностью, на двойной спирали ДНК возникает разрыв с образованием одноцепочечного участка ус (whisker) (рис. 5.5). [c.112]

I вносит в двуспиральную ДНК одноцепочечные разрывы и затем быстро их зашивает, так что разрывы существуют лишь в течение очень короткого промежутка времени). [c.144]

Вирионы HBV содержат кольцевую частично двухцепочечную молекулу ДНК. Одноцепочечные участки составляют в разных молекулах от 15 до 60 % их длины. Таким образом, ДНК состоит из длинной цепи L, которая имеет постоянный размер (3220 нуклеотидов) во всех молекулах, и короткой цепи S, которая в разных молекулах варьирует по длине (1700-2800 нуклеотидов). В инфицированных клетках вирусная ДНК-полимераза достраивает вторую цепь и полностью двухцепочечная ДНК подвергается репликации. [c.323]

Матрица. Предпочтительная матрица - двухцепочечная ДНК. Одноцепочечная ДНК также может служить матрицей. Ни РНК (как одноцепочечная, так и двухцепочечная), ни гибриды РНК—ДНК не могут служить эффективными матрицами. [c.52]

Отметим, что у образовавшейся здесь двухцепочечной молекулы кДНК отсутствуют липкие концы такие молекулы ДНК, с тупыми концами, можно клонировать при помощи нескольких процедур, сходных с той, какая представлена на рис. 5-78, хотя и менее эффективно. Можно, например, пришить к концам к ДНК синтетические олигонуклеотиды, содержащие участки, в которых рестрицирующий фермент вызывает разрыв, или присоединить ферментативным путем к концам молекулы к ДНК одноцепочечные хвосты , чтобы облегчить включение этой молекулы в клонирующий вектор присутствует лишь некодирующая ДНК. составляющая, как известно, большую часть массы такого генома (см. разд. 9.1.3). [c.329]

Топоизомераза I и белки, прочно связанные с ДНК, входят в состав транскрипционно активного хроматина [167]. С. Элгин (США), а за нею ряд других авторов показали, что транскрипционно активный хроматин содержит топоизомеразу 1, фермент, релаксирующий суперспи-рализованную ДНК- Впервые это было продемонстрировано на цитологических препаратах политенных хромосом дрозофилы с помощью флюоресцирующих антител к топоизомеразе I. Этот фермент вносит в ДНК одноцепочечный разрыв и ковалентно связывается с образовавшимся 5 -концом ДНК. Это позволяет ДНК свободно вращаться в месте разрыва. Затем фрагмент отщепляется, а фосфо-диэфирная связь в ДНК восстанавливается. По молеку- [c.160]

Третьей характерной особенностью активного хроматина является гиперчувствительность к ДНКазе I. Это явление заключается в раннем появлении под воздействием ДНКазы I двухцепочечных разрывов в строго определенных участках гена. ДНКаза I обычно вносит в ДНК одноцепочечные разрывы и поэтому появление двухцепочечных разрывов при переваривании свободной ДНК происходит лишь на поздних стадиях гидролиза. Здесь же такие разрывы появляются на ранних этапах переваривания хроматина. [c.165]

Весьма полезным методом изучения ДНК-белковых взаимодействий является так называемый футпринтинг (рис. 4.15). Некий белок, связанный с определенным участком ДНК, защищает его от расщепления, например, ДНКазой, которая в обычных условиях случайным образом вносит в ДНК одноцепочечные разрывы. На практике обычно вначале получают фрагменты ДНК, меченные по одному из концов одной цепи. Затем добавляют такое количество ДНКазы, чтобы внести в каждую молекулу в среднем не более одного разрыва, ДНК денатурируют и проводят гель-электрофорез. [c.102]

Репликативная и нерепликативная транспозиция на основе одной промежуточной структуры. Как донорная. так и реципиент-ная ДНК представлены в виде колец. Точками обозначены 5 -концы донорного элемента. Серыми прямоугольниками выделены сайты-мишени реципиента (дупликации сайтов-мишеней, окружающие донорный транспозон, для удобства не указаны). Первый этап состоит в образовании в донорной и реципиентной ДНК одноцепочечных разрывов с выступами. У донора они происходят с обоих З -концов элемента, а у реципиента-в сайте-мишени с образованием одноцепочечных выступов определенной длины (см. рис. 10.1). На следующем этапе свободные 5 -концы реципиента лигируют со свободными З -концами донора с образованием промежуточного продукта [К. Mizuu hi. ell 39 (1984), p. 395.] [c.235]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология