Динуклеотиды, комплексы с актиномицином

Концепция локальной симметрии играет важную роль и при анализе структуры комплекса актиномицина D с дезоксигуанозином (см. рис. 23.31,/ ).Стехиометрия этого комплекса такова, что на две молекулы дезоксигуанозина приходится одна молекула лиганда. Структура имеет ось приблизительной симметрии j, поворот вокруг которой переводит две молекулы дезоксигуанозина друг в друга и, кроме того, меняет местами пептидные кольца актиномицина. Комплекс из двух оснований и плоского кольца актиномицина очень похож на структуру с интеркалированным лнгандом. Плоскости всех трех ароматических колец параллельны друг другу, и, если к двум гуаниновым основаниям присоединить два цитидина, структура будет иметь почти такую же геометрию, как и динуклеотид с интеркалированным лнгандом. Осн симметрии j в таком комплексе — это такие же осн, как и в комплексе ДНК с интеркалированным лигандом (см. структуру комплекса ДНК с этидием). Этн осн изображены на рнс. 23.31,В, где представлена также структура комплекса ДНК с актиномицином, полученная путем экстраполяции данных для дезоксн-гуанозина. [c.377]

Изложенная точка тоения на структуру комплекса актиномицина В с ДНК не является общепризнанной. Существует и другая гипотеза, согласно которой актиномицин не интеркалирует в ДПК, а связывается в малой бороздке, причем структура комплекса актиномицина О с динуклеотидом ОрС не отражает структуры его комплексов с протяженными молекулами ДНК.- Прим. перев. [c.62]

Было установлено, что d(pGp ) образует прочный комплекс с актиномицином D со стехиометрией 2 1. Более того, этот комплекс образуется кооперативно, что указывает на возможное спаривание оснований двух цепей d(pGp ) в комплексе. Комплексы всех других исследованных динуклеотидов имеют такую же конечную стехиометрию, но их образование носит некооперативный характер. Этот факт позволяет сделать вывод, что спаривания оснований не происходит даже в комплексах с самокомплементарными динуклеотидами типа d(p pG). [c.379]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология