Белка внутренняя часть диэлектрическая проницаемост

Имеется ли в исследуемой структуре что-либо знакомое или она совершенно необычна Из сказанного выше следует, что каждому структурному уровню белков или нуклеиновых кислот, по-видимому, присущи общие характерные особенности. Некоторые из этих характеристик являются результатом действия сил, определяющих структуру. Даже если мы не можем точно предсказать структуру, иногда оказывается возможным распознать некоторые ее элементы, противоречащие нашим сегодняшним представлениям. Такие структурные особенности часто оказываются очень важны для понимания функции Например, в случае глобулярных белков можно в первом приближении предсказать особенности распределения аминокислотных остатков между поверхностью молекулы и внутренней областью. Заряженные группы, например лизин или аргинин, обычно сольватированы и окружены противоионами. Перенос изолированной боковой цепи такого типа внутрь глобулы не только приведет к потере энергии сольватации, но и будет весьма дорого стоить из-за электростатических взаимодействий. Например, энергия притяжения двух противоположно заряженных ионов примерно равна е /ег, где е — элементарный заряд, г — расстояние между ионами, рассматриваемыми как точечные заряды, а — диэлектрическая проницаемость среды между ними. Вне белковой глобулы е равно примерно 80, а внутри — приблизительно в 20 раз меньше. Поэтому, если необходимо перенести заряд внутрь, энергетически чрезвычайно выгодно поместить возможно ближе к нему еще один заряд противоположного знака. Обнаружение зарядов внутри глобулы белка подобно обнаружению оазисов в пустыне. Вероятно, они находятся там не случайно. [c.28]

Остатки тирозина, обладающие малым сродством к воде, очевидно, находятся во внутренней гидрофобной части макромолекулы (отличающейся низкой диэлектрической проницаемостью) и потому слабо поддаются ионизации. Источником дополнительной стабилизации для некоторых групп могут служить водородные связи. Подобного рода замаскированные группы наблюдаются и в других белках это относится также и к сульфгид-рильным группам цистеина. [c.118]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология