Молекулярная структура и компьютерная графика

Молекулярное моделирование. Необходимо проводить различие между моделированием статических, жестких структур и динамическим представлением подвижных структур. Для первого имеется много прикладных программ, однако программное обеспечение, дающее высокий уровень диалогового режима, может быть достигнуто лишь на ПРС высокого уровня. Такая программа должна обладать следующими характеристиками иметь графический ввод в виде двумерного рисунка с генерацией соответствующей трехмерной структуры давать изображение молекул, содержащих до 1000 атомов, в виде стержневых, шаростержневых и заполняющих пространство моделей, которыми можно управлять в реальном масштабе времени удалять закрытые от наблюдателя поверхности и показывать тени. Цель проекта состоит в развитии ПРС высокого уровня как независимых инструментов для молекулярного моделирования, которые бы имели высокую ценность для обучения и исследовательской работы. Однако в области динамического моделирования остается сделать еще очень многое. Компьютерная графика представляет собой идеальный инструмент для визуализации изменений в системе как функции времени, в особенности это относится к взаимным смещениям атомов в молекуле. Поэтому она должна в первую очередь использоваться для иллюстрации механизмов некоторых фундаментальных реакций, таких, как перечисленные ниже. [c.149]

КОМПЬЮТЕРНАЯ ГРАФИКА ПОКАЗЫВАЕТ МОЛЕКУЛЯРНЫЕ СТРУКТУРЫ В ТРЕХ ИЗМЕРЕНИЯХ. [c.233]

Еще совсем недавно компьютерные программы для построения изображений служили лишь для моделирования и изображения структур по картам электронной плотности молекул, установленным посредством рентгеноструктурного анализа. Но в последние несколько лет молекулярная компьютерная графика начала развиваться в новом направлении, что значительно улучшило нашу способность представлять в пространстве сложные структурные фрагменты. Стали доступными компьютерные графические станщ1И, которые могут генерировать трехмерные структуры молекул, позволяют медленно вращать изображение молекулы на экране и выделять особым цветом наиболее интересные структурные компоненты. В результате даже неопытный исследователь может сразу увидеть такие пространственные соотношения, которые в противном случае остались бы незамеченными. По мере того как подобные графические станции становятся все более доступными, они будут служить все более важным аналитическим [c.232]

Способ действия токсина на молекулярном уровне пока неясен, но вероятно, что его мишенью могут быть рецепторы фос-фатидилхолина и N-ацетилгалактозамина [635]. Химено и др. [636] предположили, что в действии этого токсина участвуют нуклеотидные производные. Харди [618], используя возможности компьютерной графики, создал модель взаимодействия между токсином и рецепторами насекомых, которая смогла предсказать структуру инсектицидного белка. После того как станут известны вторичная и третичная структуры белка, может быть описан его активный центр это могло бы привести в конечном [c.311]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология