Нуклеотидные последовательности канонические и сплайсинг

Тщательное изучение нуклеотидных последовательностей границ сплайсинга показывает, что единственное их общее свойство-наличие таких коротких канонических последовательностей. Они находятся на границах экзон—интрон чрезвычайно большого числа видов организмов, от животных до дрожжей. Но никакого другого существенного сходства не удается выявить даже при рассмотрении отдельных групп интронов (таких, как интроны определенного вида животных, интроны семейства генов и т.д.). [c.326]

При сравнении нуклеотидных последовательностей мРНК и структурного гена можно выделить области границ между экзонами и интронами. Для них характерно наличие двух важных свойств (или их отсутствие). Во-первых, отсутствие сколько-нибудь значительной гомологии между двумя концами интрона. Это исключает возможность образования значительного по размеру участка со вторичной структурой, связывающего концы интрона вместе, что послужило бы предварительным этапом для сплайсинга. Во-вторых, оказалось, что на границе экзон—интрон имеется каноническая, присутствующая в разных генах, хотя и довольно короткая, последовательность повсеместное присутствие этой последовательности вызывает предположение о ее участии в сплайсинге в ядре (гл. 26). [c.255]

Нуклеотидные последовательности в местах соединения экзонов и интронов весьма консервативны и практически одинаковы во всех генах ядерных мРНК почти у всех изученных видов (табл. 8.4). 5 -сайт сплайсинга чаще всего фланкирует последовательность RG (где R-пурин), а З -сайт-всего один остаток G. Тем не менее последовательности, фланкирующие интроны извне, могут значительно варьировать, а мутации в них никогда не предотвращают сплайсинг, хотя и могут влиять на его скорость. Нуклеотидные последовательности, фланкирующие интроны изнутри, отличаются больщим постоянством. Первыми двумя нуклеотидами на 5 -конце интрона в РНК почти всегда являются GU (исключение, ОС, встречается всего в двух случаях) следующие четыре нуклеотида могут немного варьировать, но. по-видимому, канонической является последовательность AGU. Замена остатка G или и в месте сочленения обычно блокирует сплайсинг, а замены соседних оснований влияют на сплайсинг по-разному. Указанные щесть нуклеотидов на 5 -конце интрона и определяют специфическую функцию 5 -сайта сплайсинга. Даже криптические (скрытые) сайты сплайсинга (разд. 8.5.е), которые используются только иногда или в тех случаях, когда основные сайты повреждены или пропущены, содержат элемент GU на 5 -конце вырезаемой последовательности. На З -конце интрона всегда находится пара AG, перед которой в интронах млекопитающих чаще всего находится богатый пиримидином участок (Y NYAG). Мутации, приводящие к замене константных А и G на другие основания, также блокируют сплайсинг в этом сайте. [c.105]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология