Полипептиды, виртуальные связ

Имея конформационные карты, мы может по формулам (24) — (26) вычислить термодинамические величины и затем, используя хорошо разработанный матричный метод [6,7, 162], рассчитать Вернее, нас удет интересовать не /12, а характеристическое отношение где I — виртуальная связь в полипептиде — длина вектора, проведенного от одного атома С к последующему (3,80 А), а п — число пептидных [c.148]

Как отмечалось в гл. 5, расстояние между соседними а-углеродными атомами фиксировано и равно 3,8 А, что обусловлено плоской тракс-коиформацией амидной группы. Таким образом, при вычислении внутрицепочечных расстояний полипептид может быть представлен как последовательность виртуальных связей,соединяюших соседние атомы С . Эти виртуальные связи изображены пунктирными прямыми на рис. 18.12. Цепь из (и + 1) остатка имеет п таких связей, которые последовательно проходят от атома до атома С . В этой схеме концами цепи следует считать атомы и С , а не амино- и карбоксильную группы. [c.139]

В случае полиэтилена / = 0,83, а = 6,7. Поэтому = 0,1и, или п/М = 10, т.е. статистический сегмент состоит приблизительно из 10 реальных связей. Для полипептида из п виртуальных связей/ = 0,95, а значение зависит от природы боковой группы (см. табл. 18.1). n/N равно 2,4,10,3 и 129 для полнглицина, поли-Ь-аланина и поли-Ь-пролина соответственно. Отвечающие им значения составляют примерно 8,6, 37 и 460 А. [c.152]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология