Сателлитная ДНК, кинетика ренатурации

Кинетика ренатурации денатурированной ДНК мыши имеет качественно такой же вид, что и изображенная на фиг. 247 кинетика ренатурации ДНК теленка, за исключением того что в ДНК мыши выявляется 10%-ный компонент (сателлитная ДНК), ренатурирующий с еще более высокой скоростью, чем фракция избыточной ДНК теленка. Как видно из фиг. 246, 50%-ная ренатурация сателлитной ДНК мыши наблюдается при значении at = 0,001 моль-с, свидетельствуя о том, что молекулы этой фракции должны присутствовать в более чем 10 -кратном избытке в расчете на геном. Исследование ДНК самых различных высших организмов, относящихся как к растительному, так и к животному царствам, продемонстрировало, что присутствие в геноме избыточных последовательностей является универсальным явлением, хотя доля избыточной ДНК, а также степень избыточности варьируют у различных видов в очень широких пределах. Однако ии у одного из прокариотов или вирусов сколько-нибудь значительной избыточности выявить не удалось. [c.505]

Если ДНК содержит понторы, после фрагментации соответствующие сегменты будут присутствовать в большей концентрации, чем сегменты с уникальными последовательностями. Поэтому ренатурация повторов будет идти быстрее, что учитывает множитель п в уравнении (23.67). Из рис. 23.20 видно, что poly (А U) и сателлитная ДНК мыши ренатурируют несравненно быстрее, чем другие ДНК. Если гомогенная ДНК содержит повторы с различной кратностью, удобно ввести так называемый параметр кинетической сложности, Х . Параметр кинетической сложности — это такая длина цепи ДНК, в которой содержится по одной копии каждого уникального участка всей последовательности. Для последовательности, в которой все повторы имеют одинаковую кратность, Х = Т/п. Уравнение (23.67) позволяет экспериментально определить Х при условии, что была проведена калибровка константы Atj. Для гомополимера = 1 для чередующейся последовательности типа d(AT) d(AT) Х = 2 для уникальной последовательности без повторов Х = Т. Изучение кинетики ренатурации позволяет получить определенную информацию о средней повторяемости последовательностей, если известен размер генома. [c.350]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология