Уникальные последовательности ДНК

Дупликации сравнительно небольших участков ДНК, состоящих из нескольких нуклеотидов, входящих в состав одного гена или соседних генов, происходят в процессе эволюции весьма часто. Около 10% генома мыши составляют высокоповторяющиеся нуклеотидные последовательности, причем каждый такой участок содержит около 10 нуклеотидов и повторяется тандемно примерно 10 раз (гл. 9). В основном эти последовательности сосредоточены в гетерохроматиновых центромерных участках хромосом. Другие, более длинные последовательности повторяются реже они рассеяны среди уникальных последовательностей ДНК и транскрибируются вместе с ними (см. рис. 9.5). Участки с высокой и умеренной повторностью нуклеотидных последовательностей имеются в генотипах многих млекопитающих, а также у представителей других классов животных и у растений. [c.40]

Одним из путей конструирования промотора является, очевидно, сборка уникальной последовательности ДНК, способной создать сигнал для связывания РНК-полимеразы. Исходя из размеров бактериального генома, можно думать, что минимальная длина участка, достаточная для создания необходимого сигнала, составляет 12 п.н. Более короткие последовательности, вероятно, встречаются довольно часто (просто в результате случайных событий) и могут создавать ложные сигналы. Последовательность из 12 п.н. не обязательно должна быть непрерывной. Так, если определенное число пар оснований разделяет две короткие постоянные последовательности, их совместная длина может составлять менее чем [c.143]

Иначе говоря, идентификация одной четкой полосы показывает, что положение сайта рестрикции однозначно определено по отношению к концу нуклеосомной ДНК (который соответствует разрезу нуклеазой микрококков). Таким образом, нуклеосома обладает уникальной последовательностью ДНК. [c.377]

СЛОЖНОСТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ ДНК. Суммарная длина уникальных последовательностей ДНК данного препарата. [c.526]

Подводя итоги, можно сказать, что до получения более точных данных среднюю степень нуклеотидной гетерозиготности для структурных генов и других уникальных последовательностей ДНК эукариот, вероятно, правильно оценивать величиной 1-2%. [c.103]

ДНК в данном случае скорость реассоциации зависит от числа идентичных (или почти идентичных) повторов. Наконец, имеются еще уникальные последовательности ДНК (единичные копии), кинетика реассоциации которых сходна с таковой для бактериальной ДНК (рис. 2.78). [c.115]

Тщательный анализ зависимости количества ренатурировавшей ДНК от длины фрагментов позволяет определить среднюю длину участков с повторами и с уникальными последовательностями. Например, результаты, представленные на рис. 23.23, , показывают, что около 65% уникальных последовательностей ДНК содержат повторы, расположенные в среднем через 700 нуклеотидов. У других 20% таких последовательностей повторы встречаются приблизительно через 4000 нуклеотидов. Такие данные оказываются чрезвычайно полезными при анализе последовательности геномов эукариот. Этот пример служит прекрасной иллюстрацией того, как с помощью физико-химических методой можно решать очень важные биологические вопросы. [c.358]

Рис. 3. Кривые ренатурации ДНК мыши и ДНК из Е. соИ Фрагменты денатурированной ДНК размером 400 п н. отжигали при разных величинах Со/ и определяли количество ренатурированной ДНК с помощью хроматографии на гидроксилапатите. ДНК Е. oli денатурирует в узком интервале oi, будучи представлена только уникальными последовательностями, ДНК мыши распадается на несколько кинетических компонентов (по результатам, полученным Дж. Хирстом).

Большой размер эукариотических геномов обусловлен также наличием в них множества повторяющихся последовательностей ДНК с неизвестными функциями. На их долю приходится обычно 10%, а в некоторых случаях почти 50% генома. Более 15 лет назад при помощи кинетического анализа реассоциации денатурированной эукариотической ДНК было показано, что значительная часть ДНК ренатурирует гораздо быстрее, чем можно было бы ожидать для уникальных последовательностей ДНК. Высокая скорость реассоциации говорит о том, что такие геномы содержат фрагменты, повторяющиеся от сотен тысяч до миллионов раз. В настоящее время с помощью молекулярного клонирования и секвенирования подтверждено существование таких последовательностей ДНК с большим числом повторов, которые, подобно повторяющимся генам, могут располагаться либо тандемно, либо изолированно друг от друга среди неродственных геномных локусов. [c.13]

Роль амплификации последовательностей ДНК в эволюции генома. Сходные последовательности в пределах одного генома в принципе могут возникать как независимо, так и при копировании исходной уникальной последовательности ДНК-после-довательности- родоначальника . Вероятность того, что две сходные последовательности возникли независимо, тем меньше, чем больше их сходство и длина. Нет сомнений, что именно увеличение числа предковых последовательностей привело к появлению семейств сходных последовательностей, которые составляют значительную часть современных геномов. Увеличение числа копий сегментов ДНК в ходе эволюции или в процессе эксперимента называется амплификацией. За амплификацию последовательностей в составе кластеров или последовательностей, рассеянных по новым геномным локусам, отвечают разные механизмы (гл. 10). Если основная последовательность удовлетворяет физиологические потребности организма, то образование дополнительных ее копий в геноме не приводит к особым преимуществам- подразумевается, что все эти копии, кроме одной, не содержат мутаций, включая нуклеотидные замены, делеции и вставки. Одна измененная копия может быть нефункциональной или выполнять какие-то новые функции либо служить регуляторным элементом. Если такие измененные последовательности окажутся полезными, то они сохранятся под давлением отбора. В противном случае эти последовательности следует отнести к псевдогенам. Таким образом, амплификация ДНК создает основу для эволюции. [c.159]

Вторую батьшую разнородную группу составляют подвижные (мобильные) генетические элементы разной природы. На нх датю приходится значительная часть генома — 10—20 о. В отличие от генов первой группы, осуществляющих общеклеточные функции, отдельные семейства которых сгруппированы в одном или нескольких районах эукариотического генома, подвижные элементы рассея-иы по геному, перемежаясь с уникальными последовательностями ДНК (см. гл, XI). [c.190]

Транскрибируемость уникальных последовательностей ДНК в мозге млекопитающих прогрессивно возрастает в позднем эмбриогенезе и раннем постнатальном онтогенезе, достигая максимума к моменту функционального созревания. Обнаружено, что транскрибируемость генома в различных отделах мозга человека неодинакова в гностических областях коры больших полушарий она выше, чем в проекционных, в лобной коре левого полушария значительно выше, чем правого, в мозжечке и [c.25]

Дальнейший анализ полученных фракций ДНК велся двумя методами (см. рис. 23). Первый метод, коренатурация следовых количеств меченой ДНК с избытком немеченой ДНК, позволял сравнивать разные препараты ДНК в целом. Поскольку повторяющиеся последовательности могут встречаться в любых участках генома, то их исключали из анализа и сравнивали между собою только уникальные последовательности ДНК, ренатурирующие в интервале Со/ от 10 до 10 . Чтобы этих последовательностей было достаточно, работали с фракциями ДНК размером 5 т. п. н. Если ренатурировать любую меченую ДНК с избытком немеченой тотальной ДНК, то происходит, [c.134]

Для выявления точковых мутаций, небольших делеций и инсерций в исследуемых генах используется множество различных подходов, основанных на методе ПЦР, благодаря которому можно многократно увеличить уникальную последовательность ДНК, а затем проанализировать её на предмет мутации. С помошью специфических олигонуклеотидных праймеров проводят амплификацию кодирующих участков геномной ДНК в случае, если известна экзон-интронная структура исследуемого гена. [c.265]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология