Тиоредоксин создание активного центра

Создание нового активного центра в молекуле тиоредоксина. Недавно при использовании в качестве исходной молекулы инертного белка тиоредоксина после проведения предварительного компьютерного дизайна удалось внедрить в его полипептид-ную цепь новый активный центр, способный осуществлять гидролиз активированных эфиров [10]. В этом случае для решения проблемы были использованы знания, накопленные при исследовании механизмов функционирования каталитических антител (абзимов). Была создана серия виртуальных модифицированных молекул тиоредоксина с минимальной общей свободной энергией. Требуемое высокоэнергетическое состояние конкретных молекулярных участников реакции моделировали с помощью боковых цепей аминокислотных остатков, ориентированных в пространстве с целью создания условий, необходимых для осуществления катализа (реакция а). На рисунке справа (б) изображена схе- [c.282]

Был получен набор (клонотека) вариантов, по-разному ориентированных в пространстве боковых цепей ротамеров), находящихся в высокоэнергетическом состоянии, которые размещали в различных участках полипептидной цепи тиоредоксина таким образом, чтобы они сохраняли способность взаимодействовать с субстратом. (Ротамерами называют статистически значимые конформации боковых цепей аминокислотных остатков в составе полипептидной цепи). Путем теоретической оценки способности предполагаемых активных центров, сформированных в разных участках полипептидной цепи, взаимодействовать с субстратом удалось предсказать несколько протозимов , потенциально способных осуществлять соответствующую реакцию. Экспериментальное исследование показало, что, действительно, такие белки гидролизовали эфир по механизму нуклеофильного катализа с участием остатка His. Хотя удельная активность подобных искусственных ферментов была умеренной (на уровне абзимов первого поколения), сам подход представляется весьма перспективным, так как его реализация может способствовать созданию искусственных ферментов, катализирующих реакции, которые не происходят в природе. [c.283]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология