Вклады в стабилизацию смешанный

На рис. 1.18 сопоставлены кристаллографические структуры нативной молекулы HIV-1 протеиназы и ее ингибиторного комплекса, а на рис. 1.19 приведена карта расстояний между атомами (до 10 А) двух ассоциированных молекул протеиназы. Наибольший вклад в стабилизацию димера вносят невалентные контакты двух пар N-концевых (1—8, 101—108) и С-концевых (87—99, 187—199) фрагментов, образующих между собой многочисленные и разнообразные по своей природе контакты (дисперсионные, электростатические и посредством водородных связей). Укладка в процессе димеризации этой плотноупакованной и, по-видимому, наиболее стабильной части HIV-l протеиназы оказывает значительное и непосредственное влияние на формирование близкорасположенного активного центра. Взаимодействия более 40 аминокислотных остатков четырех концевых фрагментов весьма избирательны. На это указывает, например, отсутствие каталитической активности у димерного комплекса, составленного из смешанных цепей вирусов HTV-l и HIV-2, имеющих близкую гомологию [385]. Для потери активности оказалось достаточно трех замен в положениях 6, 92 и 95, поскольку на всех других участках, контактирующих в димере, последовательности ферментов двух вирусов совпадают. [c.87]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология