Формамид, распрямление РНК

Как уже отмечалось, конформация РНК в растворе зависит от ионной силы раствора, температуры и других факторов. Так, в зависимости от условий высокополимерная РНК может существовать в виде трех крайних конформаций — компактного клубка, палочки и развернутой нити. Эти структурные формы РНК обратимы (рис. 54). При низкой ионной силе раствора и комнатной температуре молекула РНК имеет форму асимметрической компактной палочки, построенной из располон енных в параллельных плоскостях спиральных участков с диаметром 400 А для вирусной РНК и 200 А — для рРНК кишечной палочки (рис. 54, а). При увеличении ионной силы раствора, когда возрастает степень экранирования заряженных фосфатных групп и, следовательно, уменьшается электростатическое отталкивание, компактные палочки становятся менее асимметричными и переходят в состояние, напоминающее компактные клубки (рис. 54, б). При повышении температуры раствора, уменьшении ионной силы ниже 10" (обессоленные растворы), действии кислот, щелочей, формамида и других реа1ентов происходит разрыв дополнительных связен. Полинуклеотидная цепь РНК разворачивается, приобретая форму распрямленных нитей или рыхлых беспорядочных клубков (рис. 54, в). При на1ревании разворачивание цепи РНК происходит независимо от величины ионной силы раствора. [c.432]

В простейшей форме комплементарные взаимодействия, играющие в общей рекомбинации центральную роль, можно воспроизвести в экспериментах ш vitro по ренатурации ДНК, разделенной на отдельные цепи. Такая ренатурация (или гибридизация) происходит, когда в растворе вследствие случайного соударения одиночных цепей ДНК комплементарные нуклеотидные последовательности оказываются одна напротив другой и образуют короткий отрезок двойной спирали. За этим сравнительно медленным этапом нуклеации спирали следует очень быстрый этап застегивания молнии двойная спираль при этом растет до тех пор, пока не образуется максимально возможное число водородных связей (рис. 5-59). Для образования таким путем новой двойной спирали разделившиеся цепи во время отжига должны быть выпрямлены, чтобы их основания были открытыми. По этой причине эксперименты с гибридизацией ДНК in vitro проводят при высокой температуре или в присутствии таких органических растворителей, как формамид в этих условиях плавятся и короткие спирали ( шпильки ), возникающие в одиночной цепи ДНК вследствие комплементарных взаимодействий при ее складывании саму на себя. Бактериальные клетки не переносят, разумеется, столь жестких воздействий. В них распрямление спиралей достигается под воздействием специального дестабилизирующего белка, или SSB-белка. У Е. oh SSB-белок необходим и для репликации ДНК, и для общей рекомбинации кооперативно связываясь с сахарофосфат- [c.304]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология