Нуклеотидная последовательность влияние на взаимодействие с белками

Инициация и регуляция транскрипции ДНК у эукариот с участием РНК-полимеразы в большей степени, чем у прокариот, зависит от множества других белков — факторов транскрипции, взаимодействующих с дискретными участками ДНК, образующих сложный эукариотический про.мотор. В районе промотора, прилегающего к сайту инициации транскрипции (кзп-сайту), обнаружены участки с характерными нуклеотидными последовательностями (мотивами), которые оказывают цис-действие на экспрессию близлежащего гена. Эти элементы могут взаимодействовать с РНК-полимеразой и другими белками-факторами транскрипции. Разные ядерные белковые факторы транскрипции, представляющие собой регуляторные белки, способны связываться с теми или иными нуклеотидными последовательностями ДНК, оказывая тем самым влияние На экспрессию разных генов. Такие белки, способные к диффузии [c.195]

В процессе сайт-специфической рекомбинации в обмен вступают короткие специфические нуклеотидные последовательности одной и той же или обеих спиралей ДНК, распознаваемые особым сайт-специфическим ферментом, что приводит к трансформации распределения нуклеотидных последовательностей в геноме. Любые комплементарные взаимодействия между двумя гомологичными спиралями ДНК возможны лишь тогда, когда в одной из двух цепей происходит разрьш. К числу факторов, вызывающих такие одноцепочечные разрывы, относят химические агенты, некоторые виды излучения, специфические белки. Например, у Е. соИ обнаружен белок гес B D, который вызывает в молекулах ДНК одноцепочечные разрьшы. Белок гес B D представляет собой ДНК-зависимую АТРазу, которая действует как ДНК-хеликаза, перемещающаяся по спирали ДНК и вызывающая ее расплетение. Под влиянием этого белка, обладающего нуклеазной и хеликазной активностью, на двойной спирали ДНК возникает разрыв с образованием одноцепочечного участка ус (whisker) (рис. 5.5). [c.112]

Три элемента Е в энхансере IgH взаимодействуют с разными ядерными белками, причем изменения нуклеотидной последовательности этих элементов блокируют связывание. Каков вклад указанных взаимодействий в активацию транскрипции, специфичную для клеток определенного типа, неясно, поскольку данные белки присутствуют во многих тканях. В целом имеющиеся данные указывают на то, что элементы Е не оказывают прямого влияния на клеточную специфичность, а действуют на активность энхансера. Белки, связывающиеся с последовательностью Е , связываются также и с другими промоторами, из чего следует, что их влияние на транскрипцию генов Ig носит количественный, а не качественный характер. Итак, можно сказать, что детерминантой лимфоидной специфичности энхансера IgH является октамерная последовательность [c.64]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология