Рибосомная РНК доступность в рибосомах

Многочисленные данные свидетельствуют о том, что белки в рибосомах находятся в форме компактных молекул, у которых для добавляемых реагентов наиболее доступна поверхность. Молекулы РНК также в основном доступны для воздействий извне. Около 50% общей массы рибосом находится в гидратированном состоянии. Таким образом, рибосомы представляют собой структуры, в которые сравнительно легко может проникать растворитель. Большая часть РНК (возможно, 60— 70%) складывается, образуя петли со спаренными основаниями, как это имеет место в тРНК. Для выяснения физических основ, обусловливающих связывание различных рибосомных субчастиц друг с другом, было [c.228]

В отличие от вирусных нуклеопротеидов, в рибосоме РНК не покрыта сплошной белковой оболочкой. Давно было показано, что значительные участки рибосомной РНК в рибосоме экспонированы и вполне доступны для действия внешних агентов — например, нуклеаз. Это принщ1пиальное отличие от вирусных частиц понятно, поскольку рибосома представляет собой рабочую функционируюшую структуру, где РНК должна активно участвовать во взаимодействиях с внешними факторами, а не быть хранилищем генетической информации, требующим защиты. [c.104]

Возможно, что кодонзависимое связывание фактора терминации каким-то образом делает пептидилтрансферазный центр рибосомы просто доступным для воды, которая является для него хорошим субстратом в результате перенос пептида происходит на воду, гем более что конкурирующая аминогруппа аминоацил-тРНК в данной ситуации отсутствует. Например, это могло бы быть достигнуто в результате некоторого раздвигания рибосомных субчастиц или легкого раскрывания (разрыхления) больщой субчастицы, несущей пептидилтрансферазный центр. Однако пока нельзя исключать и другую альтернативу, предполагающую непосредственное участие либо какой-то нуклеофильной группы белка RF в атаке сложноэфирной связи и промежуточном кратковременном акцептировании пептида, либо RF-фиксированной молекулы воды как специфического акцептора. [c.269]

Рибосомная РНК in situ в рибосоме доступна для действия рибонуклеазы (и, следовательно, не заключена внутри рибосомы) в отличие от вирусной РНК, которая не атакуется рибонуклеазой. Рибосома представляет собой пористую структуру, в которой примерно 50% приходится на долю воды [37]. РНК и белок, по-видимому, чрезвычайно тесно переплетены друг с другом в рибосоме. Тем не менее, как показали исследования методом дифракции рентгеновских лучей [17, 47], структура РНК и белка при этом не изменяется сколько-нибудь заметным образом. [c.24]

Эти результаты согласуются со структурной моделью рибосомы, постулирующей наличие взаимодействий между рибосомными белками и РНК, зависящих от нуклеотидной последовательности (Сох, Вопапои, 1969). В соответствии с этой моделью на поверхности риоосомы экспонированными остаются лишь немногие однонитевые петли РНК. Положение этих петель определяется специфическими спирали-зованными участками в других частях РНК, а также специфическим взаимодействием с рибосомными белками. Предложенная модель приведена на рис. 8.2. Если допустить, что рибосомы одного вида обладают одинаковой структурой, то полный гидролиз доступных для действия фермента участков нуклеиновой кислоты должен привести к воспроизводимому образованию специфических фрагментов. [c.155]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология