Олигонуклеотиды стабильность двойной спирали

РИС. 23.1. Сравнивая свойства разных олигонуклеотидов, можно получить ценную информацию о взаимодействиях, стабилизирующих двойную спираль. Сопоставление значений позволяет выяснить влияние на стабильность (И) последовательности оснований, (Б) длины двойной спирали, (В) стзкинга в одиночных цепях, (Г) наличия некомплементарных пар, СД) фрагментации цепи, (Е) длины петли в шпильках и (Ж) выталкивания оснований, нарушающих комплементарность, из спирали. [c.309]

Имеющиеся в настоящее время данные позволяют предсказывать стабильность определенных вторичных структур РНК. Стабильность зависит от типов ближайших соседних пар оснований в двойной спирали, а также от размера и структуры одиоцепочечных петель между спиральными областями. Термодинамические параметры, необходимые для таких оценок, можно определить, исследуя стабильность комплексов между короткими олигонуклеотидами, а также стабильность шпилек, образуемых синтетическими молекулами РНК. Экспериментальные данные для коротких спиралей очень хорошо описываются в рамках модели двух состояний. Использование этой модели сушественно упрощает статистико-термодинамический анализ рассматриваемых систем. Результаты исследований множества модельных соединений позволяют сделать ряд общих выводов. Соседние СС-пары стабилизируют спиральные структуры в значительно большей степени, чем последовательности, содержащие AU-пары. Наименьшую дестабилизацию в структуру шпилек вносят петли, содержащие 6 или 7 оснований. Существование двух изолированных петель, разделенных лишь несколькими парами оснований, маловероятно. Последний вывод помогает понять кооперативность плавления ДНК. [c.380]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология