Ретропозоны

Геном млекопитающих содержит несколько разных семейств коротких повторов. Короткие повторы у птиц и амфибий изучены значительно хуже. Число копий коротких повторов, например наиболее изученных повторов Alu-семейства у человека, составляет 3-10 , что соответствует 5—6% массы ДНК клетки. Такие повторы рассеяны по геному и получили название вездесущих. Повторы Alu могут находиться в интронах, на 5 -флангах генов и, наконец, в составе З -нетранслируемого участка мРНК- Нуклеотидная последовательность Alu-повтора гомологична последовательности отдельных участков 7S РНК. Структура 7S РНК достаточно консервативна у позвоночных, а гомологии в нуклеотидной последовательности прослеживаются и с 7S РНК насекомых, Поэтому семейства коротких повторов, присутствующие у разных видов, предшественником которых служила 7S РНК, также могут обладать достаточной гомологией. В то же время семейства коротких повторов, как и длинных, характеризуются видоспецифичностью, обусловленной амплификацией той или иной копии клеточных РНК, которые к тому же могли быть по-разному модифицированы в результате процессинга. Локализация ретропозонов, внедрившихся в отдельные сайты генома у предков млекопитающих, может, по крайней мере, частично сохраняться в процессе дальнейшей эволюции. Например, места локализации Alu-подобного семейства в межгенных про.межутках кластера глобиновых генов оказались достаточно сходными у мышей и приматов. [c.226]

Элементы генома, представляющие собой продукты обратной траис-крипции клеточных РНК (ретропозоны) 222 [c.353]

Детальное исследование молекулярной организации генома высших эукариот, особенно млекопитающих, показало, что существенная часть генома, около 10 % общей массы ДНК, образовалась в результате интеграции в геном фрагментов ДНК, синтезирован-лых на РНК-матрицах в результате обратной транскрипции (рис. 118, а). Впервые подобный процесс был описан при исследовании ретровирусов, в геноме которых имеется ген, кодирующий обратную транскриптазу (ревертазу) (см. гл. ХИ1). В геноме млекопитающих, птиц, амфибий и насекомых обнаруживаются ретропо-зоны, представляющие собой внедрившиеся в геном ДНК-копии, синтезированные на разных типах клеточных РНК как на матрицах. Молекулярные механизмы ретропозиции не изучены, остается не установленным источник клеточной обратной транскриптазы. Не ясно, что служит затравкой для ревертазы возможно, это шпилька на З -конце РНК, образующаяся в результате комплементарных взаимодействий. Как будет видно, структура ретропозонов позволяет с уверенностью говорить об участии обратной транскрипции в процессе их образования. Таким образом, наряду с переносом информации от ДНК к РНК осуществляется и обратный процесс — возвращение ее в геном в виде ретропозонов. У млекопитающих ретропозоны составляют более 10 % ДНК следовательно, мощность встречного потока информации от РНК к ДНК может быть существенной, по крайней мере при оценке его во временном эволюционном масштабе. Различают разные типы ретропозонов. [c.222]

Релки — прямые повторы по краям перемещающегося элемента ( ретропозона ) а — общая (пунктирная стрелка указывает на существование потока информации , направленного-На геномной ДНК) б — образование псевдогенов на процессированиой мРНК как. [c.223]

Ретропозоны. Они распадаются на два класса. Представители класса I по своему строению и механизму транспозиции схожи с ретровирусами, но не обладают их способностью к внеклеточному существованию. [c.54]

Длина ретропозонов класса II — 5—7 т.п.н. У них отсутствуют LTR-повторы, а на З -конце одной из нитеи располагается [c.55]

В качестве одного из объяснений резкого увеличения частоты транспозиций, наблюдаемого в некоторых линиях дрозофилы, была предложена гипотеза сумасшедшей копии. Она подразумевает, что активизация ретротранспозона может быть следствием мутации в последовательности самого элемента. Действительно, удалось выявить два структурных варианта ретротранспозона gypsy, различающихся по транспозиционной активности (Lyubomirskaya et al., 1990). Однако предпринятый нами анализ последовательности активно перемещающейся копии ретротранспозона opia в линии, характеризующейся очень высокой частотой его транспозиций, показал ее идентичность последовательности канонических копий (Филатов и др., 1998). В регуляторном районе активно перемещающегося ретропозона [c.34]

Do нами были найдены отличия от канонической копии, однако оказалось, что этот ранее не описанный структурный вариант ретропозона встречается во многих линиях, независимо от транспозиционной активности Do в них (Пасюкова и др., 1999). Таким образом, структурно перестроенные, сумасшедшие копии ретротранспозонов могут возникать, но не всегда именно это служит причиной активизации ретротранспозонов. [c.35]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология