Коинтеграт разрешение

Транспозиция ТпЗ происходит путем разрешения коинтеграта [c.466]

В принципе коинтеграты могут быть разрешены с помощью гомологичной рекомбинации между любой соответствующей парой точек в двух копиях транспозона (рис. 36.11). Однако на деле реакция разрешения происходит только в специфическом сайте. Этот сайт первона- [c.467]

Рис- 16. Схема транспозиции через образование Aj v. разрешение / / коинтеграта серая стрелка — транспозон [c.108]

Сайт-специфическая рекомбинация - процесс рекомбинации, осуществляемый между молекулами ДНК, имеющими низкий уровень гомологии (сходства) или вообще негомологичными. Пример сайт-специфической рекомбинации - разделение (разрешение) коинтегратов в процессе транспозиции. [c.125]

Белок TnpR, функционируя в качестве резолвазы, вовлекается в рекомбинацию между прямыми повторами ТпЗ в структуре коинтеграта. Коинтеграт представляет собой обязательный промежуточный продукт при транспозиции разрешение коинтегратов блокируется в мутантах tnpR , что ведет к образованию только коинтегрированных структур. [c.467]

Разрешение-консервативный процесс связи при этом разрываются и восстанавливаются без поглощения энергии. Для завершения реакций необходимы ионы магния если они отсутствуют, происходит лишь частичная реакция с низкой эффективностью. В результате такой реакции получаются продукты, соответствующие промежуточной стадии в разрешении коинтегратов они состоят из резолвазы, ковалентно связанной с обоими концами, образовавшимися при двухцепочечном разрезе, произведенном в ге.5-сайте. Разрезание производится симметрично в коротких палиндромных областях в результате образуются выступы из двух оснований. Развивая представление об области перекреста, расположенной в сайте I, мы можем описать реакцию разрезания следующим образом [c.468]

Область перекреста для действия резолвазы проявляет гомологию с последовательностями 1RL и IRR. Последовательность длиной в 34 пары оснований, включающая 1RL, имеет только семь несоответствующих пар по сравнению с инвертированными повторами, лежащими в концах G-сегмента. Отсюда следует, что инверсия / ш-сегмента Salmonella и G-сегмента фага Ми происходит с помощью сайтспецифической рекомбинации между инвертированными повторами, механизм которой имеет общие черты с реакцией, участвующей в разрешении коинтегратов ТпЗ. [c.472]

Транспозоны, повсеместно распространенные в живой природе, являются мобильными генетическими элементами, обладающими способностью перемещаться из одной части генома в другую путем вырезания и последующей интеграции по механизму, независимому от гомологичной рекомбинации. Отдельные представители этого обширного семейства мобильных генетических элементов бактерий сильно различаются по своей структуре и механизмам внутригеномного перемещения. В настоящее время известно, по крайней мере, четыре механизма транспозиции [104]. При консервативной транспозиции транспозон вырезается из репликона-донора и в неизменном виде интегрируется в репликон-реципиент. Образовавшаяся в исходном репликоне брешь восстанавливается в результате репарации. Репликативная транспозиция характеризуется тем, что транспозон не вырезается из локуса, в котором он расположен. Вместо этого репли-кон-донор и репликон-реципиент образуют коинтеграт (объединяются друг с другом), в процессе формирования которого возникает вторая копия транспозона. Следующее за этим разрешение коинтеграта приводит к разделению репликонов, каждый из которых становится обладателем копии исходного транспозона. [c.78]

Стабильность. Как и всего живого, главное в жизни плазмид — это обеспечение своего стабильного сушествования. Для этого в процессе эволюции у них выработалось несколько механизмов надежный контроль числа копий, точное распределение плазмидных ДНК по дочерним клеткам, разрешение коинтегратов и постсегрегационная гибель бесплазмидных клеток (см. обзор Nordstrom, Austin, 1989). [c.70]

Рис. 3.4. Механизм разрешения коинтегратов а — образование коинтсфата, б — разрешение коинтеграта — сайт разрезания коинтеграта

Транспозиция ТпЗ и родственных ему простых транспозонов происходит репликативным путем с образованием коинтеграта (рис. Ю.Ш). Этот коинтеграт содержит прямые повторы ТпЗ и два сочленения между донорной и реципиентной ДНК. Для его образования. нужна транспозаза-продукт гена tnpA, а также элементы IR-L и 1R-R необходим также репликативный аппарат клетки-хозяина. Разрешение включает внутримолекулярную сайт-специфическую рекомбинацию между двумя г№сай-тами двух ТпЗ-элементов (рис. Ю.6) и протекает при участии продукта гена iw/ R-белка резолвазы. Если ген tiipR отсутствует, то разрешение может происходить при помощи рекомбинационного аппарата [c.234]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология