Поатомный поиск структур по фрагментам

Поиск по комбинациям символов происходит медленнее, чем поиск по фрагментам, но часто дает исчерпывающий ответ. Третий уровень — поатомный поиск — является длительным процессом, поскольку он включает генерирование таблицы связей (36, 33] для молекулы и последующий подробный поиск по всей базе данных. Поатомный поиск задается как поиск некоторого набора узлов, соединенных друг с другом определенным образом. Этот тип поиска используется в тех случаях, если запрос требует поиска соединений, содержащих определенные типы атомов, связанных определенным образом. Поскольку такие методы поиска обычно требуют много времени, довольно часто путем предварительной отбраковки число подлежащих обработке структур сводится до минимума (два рассмотренных выше метода поиска могут служить примерами подобных методик). Все методы, используемые в системе ROSSBOW, подробно описаны Б литературе [36—38]. [c.452]

Основу системы ХИМИНФОРМ составляет Регистрационная система химических соединений, обеспечивающая идентификацию и регистрацию всех вводимых в систему структур. Каждое соединение представляется в Регистрационной системе топологической (поатомной) записью и регистрационным номером, по которому осуществляется пополнение массивов системы сведениями о данном веществе, В конце 1985 г. Регистрационная система содержала 1,2 млн структур и около 5 млн записей об их свойствах, реакциях и областях применения. Выходными данными системы являются машиночитаемая база структурных данных (СД) и специализированные указатели. База СД — это крупнейшая документально-фактографическая база данных в рамках стран — членов СЭВ. Она содержит библиографическое описание документа, номер реферата в РЖХим и для каждого соединения — его регистрационный номер, брутто-формулу, названия (систематическое и тривиальное), важнейшие структурные фрагменты и otoбeннo ти структуры, записанные на формализованном языке (структурные и синтаксические термы), вырабатываемые из поатомной записи соединения, сведения о свойствах, реакциях и областях применения, также представленные с помощью формализованного языка (предметные термы). База СД обеспечивает поиск индивидуальных соединений и классов соединений, а также сведений о них по всем элементам данных, входящих в базу, и их сочетаниям. [c.68]

Для выполнения требования универсальности необходимо иметь в ИПС запись каждой структуры в виде варианта матрицы связи, в которой перечисляются все атомы структурной формулы и связи между атомами. Различные варианты подобных матриц разобраны нами в гл. 4. Одпако подобным поатомным матрицам присущ существенный недостаток поиск по ним сложен. Как известно, объектом внимания химика, носителем физических, биологических, химических и других свойств является не отдельный атом, а совокупность атомов. Необходимо уметь быстро идентифицировать в ЭВМ химически значимые фрагменты. Иными словами, машинная запись структурной формулы должна обладать свойством, обеспечивающим легкость алгоритмического нахоледения химически значимых групп. Целый ряд исследований показал, что поиск химических соединений по структурным признакам исключительно и неносредственно только по поатомпым записям нецелесообразен. [c.117]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология