Карбодиимиды полинуклеотидов

При pH ниже 7 взаимодействие нуклеотидов с карбодиимидом СП протекает по фосфатной группе, что в основном приводит к превращению нуклеозид-2 (3 )-фосфатов в циклические фосфаты, а нуклеозид-5 -фосфатов — в олигонуклеотиды Однако в случае фосфодиэфиров побочная реакция по фосфатной группе не наблюдается, что позволяет успешно применять карбодиимид СП для модификации полинуклеотидов. [c.384]

Наряду с хим. св-вами, общими со св-вами нуклеозидов, Н. характеризуются рядом особенностей. В присут. конденсирующих реагентов (напр., карбодиимидов) нуклеозид-монофосфаты способны претерпевать внутримол. этерификацию (фосфорилирование) с образованием циклических 3, 5 - или 2, 3 -фосфатов (см., напр., Аденозинмонофосфат циклический) или же межмол. дегидратацию, приводящую, в зависимости от условий, к динуклеозидшчюфосфатам или продуктам олиго- и поликонденсации (олиго- и полинуклеотидам). Действие аналогичных реагентов превращает ну-клеозидтрифосфаты в циклич. триметафосфаты. Фосфорилирование по своб. гидроксилам или имеющимся остаткам фосфорной к-ты приводит к разл. полифосфатам. Фосфатная группа в Н. может быть отщеплена действием ферментов (фосфатаз), что приводит к нуклеозидам, проалкилирована (наряду с N-атомами) с образованием преим. моноэфиров Н. или же превращена в фосфамидную группу. [c.305]

С наибольшей скоростью модифицируются редкие компоиенты нуклеиновых кислот — инозин и псевдоуридин. Реакиия с карбодиимидом практически не идет с двухцепочечными полинуклеотидами. В нуклеиновых кислотах, содержащих как двухцепочечные, так и одиоцепочечные участки, модифицируются только последние, что используется при исследованиях вторичной структуры тРНК. [c.389]

Одноцепочечные полинуклеотиды, в которых отсутствуют внутримолекулярные водородные связи между основаниями (например, полиуридиловая кислота), гладко реагируют с карбодиимидом СП ° Зо скорость реакции при этом несколько ниже, чем для уридина (см. табл. 5.7). С двухцепочечными комплексами рибо-полинуклеотндов и ДНК реакция практически не происходит Скорость и степень взаимодействия карбодиимида СП с тРНК сильно зависит от условий реакции При pH 8 и 30—40° С достигается полная модификация всех реакционноспособных остатков нуклеозидов в присутствии же ионов при более низкой тем- [c.384]

Модификапия полинуклеотидов карбодиимидом приводит к существенному изменению их способности расщепляться нуклеазами. Динуклеотиды, содержащие остаток модифицированного уридина, устойчивы к действию панкреатической пиримидил-РНК-азы Это позволяет осуществить специфическое химико-ферментативное расщепление РНК по остаткам цитидиловой кислоты si [c.385]

Схема реакций, представленная на фиг. 52, очень напоминает механизм реакций конденсации с отщеплением воды [34] при участии диалкилкарбодиимидов (R—N= =N—R )- Диалкил-карбодиимиды издавна широко используются в препаративной органической химии для синтеза фосфорных эфиров нуклеозидов, полинуклеотидов (фосфодиэфиров), полипептидов, фосфамидов, лактонов, эфиров карбоновых кислот, циклических фосфатов, пирофос тов и смешанных ангидридов кислот [34]. Хотя эти синтезы проводятся обычно в неводных растворителях, было по- [c.218]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология