Справочник химика 21

Химия и химическая технология

Статьи Рисунки Таблицы О сайте English

Фосфатные группы, водородные связи

    Строение цепочки нуклеотидов можно представить схемой (рис. IV. 1). Цепь этого типа соединяется с другой такой же посредством водородных связей, действующих между основаниями. Поэтому огромная молекула ДНК — двойная и представляет собой по конфигурации двойную спираль. Расплетаясь, каждая одиночная ветвь спирали присоединяет к себе нуклеотиды, имеющиеся в среде, и таким путем из одной двойной молекулы возникают две двойные. Водородные связи между основаниями расположены внутри спирали, а углеводно-фосфатные группы —на ее внешней части (рис. IV.2). [c.351]


    Пары оснований, связанные водородными связями Молекула ДНК обеспечивает хранение наследственной информации, закодированной определенной последовательностью оснований, присоединенных к углевод-фосфатной цепи. Установлено, что молекула ДНК является матрицей для синтеза информационной РНК , которая далее контролирует синтез белков на определенных структурах клетки, называемых рибосомы . В конечном счете каждая группа из трех оснований молекулы ДНК ответственна за совершение определенной операции при синтезе белка. Все 64 возможные комбинации трех оснований дают команды или для объединения отдельных аминокислот в белковую последовательность, или для окончания приращения цепи (некоторые комбинации кодируют одну и ту же команду). [c.321]

    Читатель может и сам поразмыслить, какая механика нужна для того, чтобы расщепить АТР и произвести сокращение. При этом небесполезно взглянуть и на структуру самого АТР. Прежде всего обратите внимание на то, что три-фосфатная группа содержит много отрицательных зарядов, взаимно отталкивающих друг друга. Представьте далее, что должно произойти, когда молекула АТР вытеснит ADP и Pi из связанной с актином миозиновой головки. При этом может нарушиться связь белок—белок вероятнее всего в какой-то определенной точке а поверхности их контакта индуцируется электростатическое отталкивание. Подумайте об образовании АТР в процессе окислительного фосфорилирования и о возможной роли протонов в синтезе АТР (разд. Д, 9,в). Не могут ли протоны оказать какое-то влияние на белок, окружающий молекулу АТР, в обратном процессе Подумайте о действии Mg +, связанного в комплексе с полифосфатной группой АТР, а также о том, что может случиться, если с соседней группой белка свяжется ион Са . Примите во внимание данные о возможном фосфорилировании боковых цепей белка на промежуточных стадиях процесса. Что произойдет, если будет фосфорилирована боковая цепь гистидина, связанная водородной связью с пептидным остовом в концевом участке спирали Автор этой книги не смог соединить все эти соображения в цельный механизм работы мышцы, но, может быть, кому-то из читателей удастся это сделать  [c.418]

    Никотинамидное кольцо НАД-Нг и изоаллоксазиновое кольцо ФАД расположены в параллельных плоскостях, так что атом азота никотинамида лежит против 2-го атома углерода рибофлавина. Неорганический фосфат соединен с двумя коферментами водородной связью, идущей к МНг-группе никотинамидного кольца. Атом водорода переносится от 4-го атома углерода никотинамидного кольца к атому азота ФАД, занимающему 10-е положение. Одновременный перенос электрона от атома азота никотинамида к С = 0-группе ФАД придает атому азота никотинамида положительный заряд, а С = О-группе ФАД — повышенную электронную плотность. Благодаря положительному заряду атом азота никотинамида притягивается к отрицательно заряженному кислородному атому фосфатного иона с образованием электростатической связи I. Электрон, перенесенный к С = 0-группе, стремится образовать связь 11. В результате возникновения этих двух связей образуется ФАД-Нг Ф. Фосфорилированный ФАД-На представляет собой макроэргическое соединение, которое может фосфорилировать АДФ либо непосредственно, либо в ходе последующего окисления. Согласно изложенной теории, разобщение фосфорилирования и дыхания, а также индуцирование АТФ-азы динитрофенолом обусловлены конкуренцией между ДНФ и 0 неорганического фосфата за четвертичный азот никотинамидного кольца. Эта конкуренция препятствует образованию ФАД-Нг- Ф. Теория Грабе дает удовлетворительное объяснение для структурных потребностей фосфорилирования в дыхательной цепи. Однако, взятая в совокупности со всем механизмом 2-го типа, эта теория не согласуется с данными о том, что способные к восстановлению компоненты дыхательной цепи, по-видимому, не являются промежуточными продуктами в реакциях фосфорилирования. [c.253]


    И сразу я почувствовал что-то неладное, хотя ошибку нашел только, когда как следует разглядел рисунки. И тут я понял, что фосфатные группы в модели Лайнуса не ионизированы, а каждая содержит связанный атом водорода и поэтому в целом нейтральна. В определенном смысле нуклеиновая кислота Полинга вовсе не была кислотой. Эти нейтральные фосфатные группы не были второстепенной деталью как раз их атомы водорода образовывали водородные связи, скреплявшие три переплетенные цепи. Без них цепи сразу же развалились бы и структура распалась. [c.92]

    Эфиры карбоновых и фосфорной кислот содержат в карбоксильных пли фосфатных группах донорные атомы кислорода, способные к образованию водородной связи поэтому при применении этих неподвижных фаз наблюдаются сравнительно высокие величины удерживания для анализируемых веществ, содержащих подвижный водород. [c.202]

    Как отметили Коттон и др. [73], способность к связыванию фосфатсодержащих молекул с белками — неотъемлемое свойство химии живых систем . Особый интерес представляет природа связывания. Боковые группы остатков аргинина могут образовывать до пяти водородных связей каждая и способны одновременно взаимодействовать с фосфатными группами и с другими группами белковой молекулы. Например, в нуклеазе стафилококков Аг -35 образует связи как с фосфатом, так и с карбонильной группой полипептидной цепи. [c.125]

    Интерес ряда исследователей направлен на то, чтобы выяснить, не заключены ли наиболее важные детали механизма мышечного сокращения в актине . Например, высказывалось предположение, что гидролиз АТР вызывает укорочение на несколько процентов сразу 15—20 молекул актина, что достаточно для общего перемещения на 10 нм, требуемого для сокращения. Согласно другой точке зрения, поперечные мостики не являются частью сократительного механизма, а служат лишь своего рода защелками . Известно, что мышца сокращается, почти не меняя объема, и поэтому все, что вызывает утолщение саркомера, будет приводить к его сокращению. Высказывалось предположение, что после гидролиза АТР отрицательно заряженные фосфатные группы связываются с нитями актина и что возникающее при этом электростатическое отталкивание вызывает поперечное утолщение саркомера . В ряде работ еще раз подчеркивалась возможность того, что энергия распада АТР трансформируется (резонансный переход) в энергию колебаний амидных связей в а-спиральных участках миозина" Эта колебательная энергия может передаваться на большие расстояния по имеющимся в белках сеткам водородных связей и каким-то образом используется в сократительном процессе. Хотя эта идея может показаться несколько искусственной, она напоминает нам, что миозиновые стержни, равно как и тонкие нити, нельзя представлять себе как инертный материал. Мы не знаем сейчас, в какой части, системы находятся сократительные пру- [c.417]

    При этом объем межплоскостного пространства не изменяется до тех пор, пока отношение М 7г остается равным 1 1, после чего замещаются ионы водорода из групп Р—ОН, связанных с соседними слоями, и это приводит к увеличению межплоскостного пространства. Тот факт, что цезий не обменивается, объясняется тем, что на первой стадии обмена решетка не может соответственным образом увеличиться, чтобы вместить такой большой катион. Различие в свойствах гелеобразного и кристаллического продуктов объясняется тем, что первый имеет более беспорядочное строение. Больший объем межплоскостных пространств и более слабые водородные связи, действующие между отдельными плоскостями в гелеобразном образце, позволяют ионам цезия обмениваться, а также способствуют гидролизу фосфатных групп. Более того, можно ожидать водородных связей со значениями энергий, обусловливающими нечетко выраженный характер кривых титрования. [c.136]

    Значительная группа связок основана на концентрированных растворах фосфатов. Высокая вязкость растворов алюмофосфатов определяется, как отмечено выше, наличием л-связей, а также связыванием катионных многогранников водородными связями. Концентрированные фосфатные растворы склонны к стеклованию, поскольку для фосфора характерны ковалентные связи и наличие ассоциатов (образующихся вследствие высоких зарядов анионов), водородные связи затрудняют подвижность ассоциатов и способствуют стеклованию. Близких взглядов придерживаются в работе [2]. [c.28]

    Ортофосфорная кислота — трехосновная кислота при 25 °С р/(1 = 2,15 р/(2 = 7,1 р/Сз 12,4. Чистая кислота и ее кристаллические гидраты состоят из тетраэдрических групп РО4, связанных водородными связями. Водородные связи существуют и в концентрированных растворах, которые имеют поэтому сиропообразную консистенцию. При концентрациях меньше 50% фосфатные анионы образуют водородные связи преимущественно с молекулами воды, а не с другими фосфатными анионами. [c.349]

    Пространств, структура ДНК описывается как комплекс двух полинуклеотидных антииараллельных цепей (рис. 1), закрученных относительно общей оси, так что углевод-фосфатные цепи составляют периферию молекулы, а азотсодержащие гетероциклы направлены внутрь (двойная спираль Уотсона-Крика). Антипараллельность полинуклеотидных цепей выражается в том, что на одном и том же конце спирали одна полинуклеотидная цепь содержит (незамещенную или замещенную) группу 5 -ОН, а другая З -ОН. Фундам. св-во двойной спирали ДНК состоит в том, что ее цепи комплементарны друг другу (см. Комплементарность) вследствие того, что напротив А одной цепи всегда находится Т другой цепи, а напротив О всегда находится С. Комплементарное спаривание А с Т и О с С осуществляется посредством водородных связей. Классич. двойная спираль Уотсона-Крика получила назв. В-фор- [c.297]


    В работах Штейнера [П и Т. М. Бирштейн [ ] было теоретически исследовано влияние ионизации оснований на переход спираль — клубок в полинуклеотидной цепи, а также влияние такого перехода на кривые титрования, т. е. кривые зависимости степени ионизации а макромолекулы от величины pH раствора. Предположим, по-прежнему, что нуклеотидные, остатки двух цепей могут соединяться друг с другом единственным образом и не будем учитывать гетерогенности состава молекулы. Каждая пара оснований молекулы может находиться в одном из трех состояний состояние О—пара мономерных единиц не связана водородной связью и не заряжена, состояние О —пара мономерных единиц не связана водородной связью и заряжена, состояние 1—пара мономерных единиц связана водородной связью и не заряжена. Поскольку ионизацию, не сопровождаемую разрывом водородной связи, мы считаем невозможной, состояние 1, в котором пара мономерных единиц заряжена и связана водородной связью, не рассматривается. Мы приписываем здесь каждой паре оснований одно заряженное состояние, поскольку константы ионизации групп —К Нг и —NH—СО— сильно различаются, так что области титрования этих групп не перекрываются, и их можно рассматривать независимо. Будем в дальнейшем для определенности считать, что заряжается кислотная группа —NH—СО—, т. е. речь идет о щелочной области pH. Ионизацию фосфатных групп мы по-прежнему не учитываем, так как в рассматриваемом диапазоне pH состояние их ионизации не меняется. Энергия электростатического взаимодействия фосфатных групп с зарядами пуриновых и пиримидиновых оснований, являющаяся функцией ионной силы раствора, может быть введена в константу ионизации этих оснований. [c.373]

    Этот остаток лизина, по-видимому, не участвует в первоначальном связывании фосфоэфира с ферментом [24]. Вместо этого субстрат образует две водородные связи между атомами кислорода фосфатной группы и водородным атомом амидной связи в цепи, а также гидратированным остатком глутамина. Водородные связи увеличивают также электрофильность атома фосфора. Еще одна водородная связь, имеющая важное значение для реакции, образуется между протонированным имидазольным кольцом и атомом кислорода субстрата, который далее отщепляется от атома фосфора. Образование этой водородной связи приводит, помимо связывания, к поляризации электронного облака в направлении, которое облегчит полный отрыв протона от имидазольного кольца в процессе гидролиза субстрата (см. ниже). [c.128]

    На основании рентгеноструктурного анализа и ранее полученных данных о строении нуклеотидов и нуклеиновых кислот Уотсон и Крик предложили для ДНК структурную модель, согласно которой макромолекула ДНК имеет форму спирали, причем в спираль закручены одновременно две молекулы ДНК (двухцепочечная спиральная структура). Эта двойная спираль имеет одну общую ось и построена так, что основания обеих цепей расположены внутри спирали, а углеводные остатки с фосфатными группами — снаружи спирали (рис. 51, 52). При этом основания одной молекулярной цепи с основаниями другой цепи образуют строго фиксированные пары, соединенные друг с другом водородными связями. Симметричное построение спирали требует постоянства межспиральных расстояний, а это возможно лишь в том случае, если размеры пар оснований, расположенных друг против друга, будут одинаковыми. Такому условию отвечают пары, построенные из одного пуринового и одного пиримидинового основания аденин — тимин и цитозин — гуанин, что обеспечивает и максимальное число водородных связей в спирали  [c.362]

    В разд. 8.4 при обсуждении молекул с высокой энергией было отмечено, что при образовании в водных растворах водородных связей такими молекулами, как Н3РО4, все четыре атома кислорода могут стать почти эквивалентными, обеспечивая почти полный резонанс двойной связи между четырьмя положениями. При таком резонансе каждый атом кислорода имеет валентность V i, удовлетворяя по связям фосфор и оставляя / на связь с водородом. Если каждая из трех групп ОН использует свой атом водорода на образование слабой связи (в 74 связи) с атомом кислорода молекулы воды, то остальные 4 связи окажутся достаточными, чтобы сделать атомы кислорода фосфата электрически нейтральными. Точно так же фосфатный кислород без атома водорода может образовать слабые (в /4) связи с атомами водорода трех соседних молекул воды, что делает его тоже электрически нейтральным. [c.257]

Рис. 2. Макромолекула дезоксирибонуклеиновой кислоты Структурная модель ДНК. состоящая из двух цепочек, извитых в виде двойной спирали вокруг центральной оси. Молекулы углевода (пентозы) представлены белыми пятиугольниками, обведенными двойной линией. Фосфатные группы представ- 1ены в виде изгиба двойной линии, соеди--миющей молекулы углеводов. От каждой молекулы углевода отходит основание в виде покрытого точечной штриховкой пяти, угольника или шестиугольника. Каждое основание связано с противолежащим на том же уровне другим основанием водородной связью. Эти поперечные связи между основаниями служат горизон альными распорками, удерживающими двойную спиральную ось и связывающими обе ее цепи вместе. Рис. 2. Макромолекула <a href="/info/459">дезоксирибонуклеиновой кислоты</a> <a href="/info/24752">Структурная модель</a> ДНК. состоящая из двух цепочек, извитых в виде двойной спирали вокруг центральной оси. Молекулы углевода (пентозы) представлены белыми пятиугольниками, обведенными двойной линией. <a href="/info/510922">Фосфатные группы</a> представ- 1ены в виде <a href="/info/1000458">изгиба двойной</a> линии, <a href="/info/698543">соеди</a>--миющей молекулы углеводов. От каждой молекулы углевода отходит основание в <a href="/info/1508648">виде покрытого</a> точечной штриховкой пяти, угольника или шестиугольника. Каждое основание связано с противолежащим на том же уровне другим <a href="/info/98131">основанием водородной связью</a>. Эти <a href="/info/301620">поперечные связи</a> между основаниями служат горизон альными распорками, удерживающими двойную спиральную ось и связывающими обе ее цепи вместе.
    Определение трехмерной структуры кристаллической нуклеазы показывает, что большинство кислотных и основных боковых групп белка взаимодействует друг с другом, образуя кластеры водородных связей. Столь же интересно распределение водородных связей между ферментом и 5 -фосфатной группой специфического ингибитора — дезокситими- [c.124]

    РИС. 7-4. Схема, демонстрирующая образование водородных связей между ноиами гуанидииия остатков Агд-35 и Аге-87 нуклеазы стафилококков и 5 -фосфатной группой ингибитора—тимидин-3, 5 -дифосфата в комплексе Е-Ь1+Са + (по Коттону и др. [73]). [c.125]

    Один из возможных результатов переноса фосфатной группы на функциональную группу белка состоит в индуцировании конформаци- онного изменения в молекуле белка. Действительно, имеются данные, весьма убедительно свидетельствующие о наличии таких изменений при действии АТР-зависимых ионных насосов (гл. 5, разд. Б,2,в) и при мышечной работе (дополнение 10-Е). Конформационные изменения могут также возникать в результате фосфорилирования регуляторных центров белков. Вполне возможно, что фосфорилирование имидазольной группы, соединенной водородной связью с группой С = 0 амидной группы полипептидной цепи белковой молекулы, ведет к таутомериым превращениям, аналогичным тому, которое было приведено в уравнении (6-84). Оно может способствовать конформационному изменению или может переводить белок в состояние, богатое энергией , способное самопроизвольно изменять свою форму, как это имеет место при мышечных сокращениях. [c.139]

    Молекула ДНК состоит из двух антипараллель-ных полинуклеотидных цепей, образующих двойную спираль. Их мономерной единицей является нуклеотид, который состоит из азотистого основания, дезоксирибозы и фосфатной группы. Соседние нуклеотиды в цепи связаны фосфодиэфирными связями, а цепи удерживаются вместе с помощью водородных связей, образующихся между комплементарными основаниями. При этом аденин образует водородные связи только с ТИМИНОМ, гуанин - только с цитозином. Процесс удвоения ДНК называется репликацией. В нем участвует множество различных белков, прежде всего ДНК-полимеразы. Каждая из цепей ДНК служит матрицей для синтеза комплементарной цепи. Комплемен-тарность оснований противоположных цепей гарантирует идентичность новосинтезирован-ной и исходной ДНК. [c.47]

    Для осуществления молекулярного клонирования недостаточно одних только ферментов рестрикции. Во-первьгх, водородные связи между теми четырьмя основаниями, которые образуют липкие концы, недостаточно прочны, чтобы удержать два объединившихся фрагмента ДНК. Необходим какой-то инструмент для устранения разрыва в сахарофосфатном остове молекулы, т. е. для восстановления связи между 3 -гидроксильной концевой группой одной цепи и 5 -фосфатной группой другой. Таким инструментом является ДНК-лигаза бактериофага Т4. Этот фермент катализирует образование фосфо-диэфирных связей между концами полинуклеотидных цепей, которые уже удерживаются вместе благодаря спариванию липких концов. Кроме того, ДНК-лигаза Т4 сшивает тупые концы, которые сближаются друг с другом после того, как объединяемые фрагменты связываются с ферментом (рис. 4.6). Во-вторых, объеди- [c.55]

    Для большинства рибонуклеозидов и нуклеотидов найдена транс-гош-кон-формация связей Сг —О2 и Сз —Оз, т. е. транс-расположтш связи О—Н относительно связи Сг —Сз и гош-от-носительно связи Сг —С/. Однако в аденозин-5- -фосфате гидроксильная группа находится в ориентации гош-гош. В молекуле цитозин-З-фосфата связь Оз —Р находится в транс-ориен-тации относительно связи Сг —С з и гош — относительно С4 —Сз. Возможно, существование такой конформации связи Сз —Оз обязано наличию водородных связей между гидроксильной группой Ог—Нг и атомами кислорода фосфатной группы. [c.172]

    Однако количество информации, заключенной в одной-единственной клетке человека, все еще намного превьннает возможности доступных в настоящее время цифровых компьютеров человек пока еще не способен выразить в цифрах все многообразие биохимических фактов и взаимосвязей. Двадцать аминокислот, из которых построены все белки-это не просто двадцать кодирующих единиц, ибо значение любой данной аминокислоты в белке может быть различным. Например, значение серина может быть обусловлено тем, что в молекуле этой аминокислоты содержится полярная гидроксильная группа, способная образовывать водородную связь. Оно может быть также связано с тем, что серин входит в качестве важного структурного элемента в состав активного центра фермента (в случае трипсина) или регуляторного центра (в случае гликоген-фосфорилазы) или же быть носителем фосфатных групп (в казеине-белке молока). Перевести четырехбуквенный язык ДНК и двадцатибуквенный язык белков на язык цифр в том случае, когда эти буквы имеют множество значений, пока еще не представляется возможным. [c.852]

    В табл. 6.3 приведены значения частот колебаний Р=0 ряда соединений тина КзР=0 (R — один и тот же заместитель). Как видно, влияние различных групп приблизительно, но не точно, соответствует индукционным эффектам заместителей, оцениваемым по их электроотрицательностям. Этот вопрос рассмотрен более подробно в разд. 6.3.4. Данные по фосфатным эфирам приведены Томасом [47] и в статьях Кетелаара [51] и Попова [52]. В конденсированном состоянии триалкилфосфаты поглощают в области 1286—1258 см- , а триарилфосфаты — в области 1314—1290 см . Это различие частот может быть связано с небольшим мезомерным эффектом с участием атомов кислорода у триалкилпроизвод-ных соединений, как это имеет место в случае повышения v O виниловых эфиров, но гораздо более вероятно, что это прямое следствие увеличения эффективной электроотрицательности атомов кислорода, обусловленного электроноакцепторными свойствами ароматических циклов. У смешанных алкиларилфосфатов наблюдаются промежуточные значения частот. Смещение полосы из этой области частот обнаруживается, когда к атому углерода в а-положении присоединена группа ОН, так как при этом образуется водородная связь с группой Р=0. При этом частота уменьшается до 1240—1180 Другие заместители при атоме углерода [c.219]

    Правило 2), как и аналогичное правило в случае полипептидной цепи, означает, что свободная энергия последовательности связанных мономерных единиц пропорциональна числу связанных единиц без учета влияния концов последовательности. которое учитывается правилами 3) и 4) и определяет кооперативность системы. Величина АН, определяющая температурную зависимость константы равновесия 5, включает в себя выигрыши энергии при замене водородных связей нуклеотид — растворитель на водородные связи нуклеотид— нуклеотид и растворитель — растворитель (ср. 23. стр. 299) и при укладывании пары связанных оснований над предыдущей парой за счет энергии их взаимодействия. С другой стороны, эта величина включает в себя проигрыш энергии за счет увеличения энергии отталкивания отрица-те 1ьг1ых Зарядов фосфатных групп ) при уменьшении расстояний между ними в результате скручивания цепей в двойную спираль. Величина Д5 включает в себя уменьшение энтропии при потере конформационных степеней свободы в паре связываемых мономерных единиц. Как показывает опыт, для всех нуклеиновых кислот з 1ачения АН и отрицательны. Отметим, что, поскольку молекулы нуклеиновых кислот практически всегда заряжены, то изменение состояния растворителя при переходе спираль — клубок (ср. 22) должно включать в себя изменение свободной энергии противоионов. В результате, константа равновесия для перехода спираль — клубок в нуклеиновых кислотах оказывается зависящей от ионной силы раствора. [c.359]

    ДНК — это тот материал, из которого состоят гены. Нить ДНК состоит из большого количества молекул дезоксирибозы, линейно связанных фос-фодиэфирными связями в 3 - и 5 -положениях молекулы сахара. Каждая молекула дезоксирибозы связана в положении Г с пурином или пиримидином. Таким образом, полинуклеотидная цепь представляет собой длинный остов, состоящий из остатков сахара и фосфатных групп, соединенных с пуриновыми основаниями — аденином (А) и гуанином (Г) и пиримидиновыми основаниями — цитозином (Ц) и тимином (Т), расположенными вдоль основной оси молекулы через строго определенные интервалы. Однако нить ДНК представляет собой не одинарную цепь, а двойную, в которой расстояние между осями цепей всегда поддерживается постоянным благодаря тому, что А из одной цепи всегда связывается только с Т из другой цепи, а Г — с Ц. Эти взаимодействия определяются размерами и формами оснований, составляющих каждую пару оснований. Возникающие при этом водородные связи определяют структурную стабильность ДНК- Однако в соответствии со знаменитой моделью Уотсона — Крика эти две цепи ДНК не просто тянутся вдоль друг друга, подобно железнодорожным рельсам, а закручены относительно друг друга, образуя периодическую двойную спираль пары оснований при этом располагаются в плоскости, перпендикулярной оси спирали. Случайный характер распределения четырех оснований вдоль цепи ДНК мог бы привести к возникновению астрономически боль- [c.69]

    В настоящее время накоплен достаточно большой фактический материал по различию физико-химических характеристик олиго-и полинуклеотидов, содержащих рибо- и дезоксирибонуклеотиды (подробнее — см. гл. 4). Разумной причиной таких различий является, по-видимому, какое-либо участие гидроксильной группы при С-2 остатка рибозы в стабилизации конформации полинуклеотидной цепи в случае рибополимеров. Помимо образования водородной связи с карбонильной группой пиримидинового основания (или N-3 пуринового основания), для объяснения наблюдаемых свойств предполагается образование водородных связей с кислоро-дами фосфатной группы [c.142]

    Скорость кислотного гидролиза фосфодиэфирных связей РНК в интервале pH 1,8—2,4, когда большая часть вторичных фосфатных групп диссоциирована, пропорциональна (в первом приближенпи) концентрации водородных ионов 32. Следует ожидать, что при pH < 1 концентрация водородных ионов не должна оказывать существенного влияния на скорость процесса. [c.564]

Рис. 3. Струтстурная модель, состоящая из двух цепочек, извитых в виде двойной спирали вокруг спиральной осп. Молекулы углевода (пентозы) иредстаплены белыми пятиугольникамп, обведенными двойной линией фосфатные группы — изгибами двойной линии, соединяющей молекулы углеводов. От каждой молекулы углевода отходит основание (покрытый точечной штриховкой пятиугольник пли шестиугольник), связанное с противолежащим на том же уровне основанием водородной связью Рис. 3. Струтстурная модель, состоящая из двух цепочек, извитых в виде двойной спирали вокруг спиральной осп. Молекулы углевода (пентозы) иредстаплены белыми пятиугольникамп, обведенными двойной линией <a href="/info/510922">фосфатные группы</a> — <a href="/info/1000458">изгибами двойной</a> линии, соединяющей молекулы углеводов. От каждой молекулы углевода отходит основание (покрытый точечной штриховкой пятиугольник пли шестиугольник), связанное с противолежащим на том же уровне основанием <a href="/info/96546">водородной</a> связью
    Эфиры карбоновых и фосфорных кислот содержат в карбоксильных или фосфатных группах атомы кислорода, способные к образованию водородной связи. Поэтому при применении эфирных неподвижных фаз наблюдаются сравнительно высокие величины удерживания для анализируемых веществ, содержащих подвижный водород. Например, удельный удерживаемый объем пропанола на диоктилсебацинате примерно такой же, как и на 1,2,3-трис(2-цианэтокси) пропане, хотя последний гораздо более полярен. Но так как взаимодействие этих неподвижных фаз с такими анализируемыми веществами определя- ется почти исключительно водородными связями, значительно более сильными, чем Другие межмолекулярные силы разд. 1.1.1), этот факт вполне закономерен [79]. По этой же причине малы различия в величинах удерживания спирта, измеренных на диоктилсебацинате, динонилфталате, дибутилфта-лате и трикрезилфосфате. Неподвижные фазы, являющиеся сложными эфирами, обладают средней растворяющей способностью по отношению к алканам, простым и сложным эфирам, кетонам, меркаптанам и тиоэфирам. Благодаря их электроноакцепторным свойствам наблюдается также сильное взаимодействие с донорами электронов, например с олефинами, ароматическими углеводородами и гетероциклическими соединениями. Селективность отделения алкенов и ароматических углеводородов от алканов возрастает в последовательности се-бацинат/адипат — фталат — тетрахлорфталат — фосфат — ацетат — бутандиолсукцинат — диэтиленгликольсукцинат — эти-ленгликольсукцинат (см. табл. УП1.16). Вообще можно заключить, что и по отношению к другим гомологическим рядам селективность не особенно сильно выражена вследствие одновременного присутствия арильных и алкильных 1 рупп, обусловливающих растворимость углеводородов, и карбоксильных или фосфатных групп, способствующих растворению кислород- [c.149]

    Активный центр фермента включает кислоту и основание между ними образуется водородная связь. Креа-тинкиназа ускоряет реакцию переноса фосфатной группы с АТФ на креатин так, что получается АДФ, фосфокреа-тин и ионы Н+. Донором ионов водорода является тиоло-вая группа 5Н , а основная группа — это имидазол. Следовательно, в активном центре креатинкиназы имеется [c.184]

    Установлено, что перенос фосфатной группы от АТФ к креатину не сопровождается промежуточным связыванием этой группы с белком фермента. Поэтому (Вест-хеймер) предполагается, что с указанным сочетанием посредством водородных связей соединяются как АТФ, так и креатин. АТФ фиксируется в удобном положении ионом магния, необходимым для действия фермента. Ион водорода кислотной группы N—Н имидазола соединяется, образует водородную связь с ионом кислорода фосфорной группы АТФ, а водород одной из аминогрупп креатина — с атомом серы активного участка фермента. [c.184]


Смотреть страницы где упоминается термин Фосфатные группы, водородные связи: [c.37]    [c.1071]    [c.136]    [c.530]    [c.136]    [c.187]    [c.863]    [c.355]    [c.373]    [c.236]    [c.279]    [c.316]    [c.338]   
Биохимия Том 3 (1980) -- [ c.0 ]




ПОИСК





Смотрите так же термины и статьи:

Водородные связи

Связь водородная, Водородная связь



© 2025 chem21.info Реклама на сайте