Полинуклеотиды

Нуклеиновые кислоты. Основным типом организации вторичной структуры нуклеиновых кислот является двойная спираль, состоящая из двух полинуклеотидных цепей. Существует ли со стороны регулярной структуры спирали дополнительное-воздействие на воду по сравнению с воздействием отдельных нуклеотидов Этот вопрос исследовался акустическим методом для различных типов спиральных структур полинуклеотидов [149], В качестве гидратационной характеристики использовали концентрационный инкремент скорости ультразвука А, который связан с парциальными объемами и сжимаемостью соотношением [c.61]

Дезоксирибонуклеиновая кислота, ДНК (разд. 25.6)-полинуклеотид, в котором остатком сахара является дезоксирибоза (в форме фуранозного цикла). [c.465]

Описывать строение мономерного звена полинуклеотидов. [c.465]

Тот же самый принцип активации карбоксильной группы используется н в синтезе белков in vivo. Карбоксильная группа аминокислоты активируется, реагируя с АТР с промежуточным образованием ангидрида. Однако следующая стадия не сводится просто к атаке такого ангидрида второй аминокислотой, поскольку синтез белков включает строго определенное последовательное присоединение многих (до нескольких сотен) аминокислот. Матрица, или организующая поверхность , должна участвовать в этом процессе для того, чтобы обеспечить правильную последовательность белковой молекулы. Макромолекулой, выполняющей функцию такой матрицы, является полинуклеотидтранс-портная рибонуклеиновая кислота (тРНК) строение полинуклеотидов описано в следующей главе. [c.56]

Рис. 3.5. Кривая плавления ДНК. оперативным расплетанием (разрывом водородных связей), которое происходит при нагревании двухцепочечных полинуклеотидов, при помощи кривых плавления (экспериментально наблюдают зависимость поглощения от температуры рис. 3.5). Середина интервала, в котором происходит переход к одноцепочечиым полинуклеотидам, называется температурой плавления (Т л). Т л зависит от соотношения содержания пар гуанин — цитозин к содержанию пар аденин — тимин, поскольку первая пара более устойчива.

Использование дихлорфосфитов — одно из последних достижений практического полинуклеотидного синтеза [40, 41]. При этом применяется активированный фосфорилирующий агент и, таким образом, отпадает необходимость в конденсирующем агенте. Однако в качестве фосфорилирующего агента выступает ие фосфат, а фосфит, повышенная реакционная способность которого делает возможным одностадийное превращение in situ нуклеозида O свободной З -гидроксильной группой в фосфомоноэфпр, а затем в фосфодиэфир путем взаимодействия со свободной 5 -гид-роксильной группой второго нуклеозида, и наконец образуется фосфат в результате быстро протекающего окисления иодом. Реакционная способность хлорфосфита так велика, что обе реакции фосфорилирования проводят при пониженной температуре. Вся последовательность операций занимает меньше одного дня (а время имеет большое значение при синтезе длинных полинуклеотидов). Ниже приведена схема одностадийного синтеза защищенного тимидилил- (3 50-тимидина. о [c.178]

Конечно, после образования пептидной связи необходимо удалить защитные группы в условиях, при которых продукт реакции не разрушается. Следовательно, защитные группы должны легко присоединяться к реагирующим соединениям и удаляться из конечного продукта в мягких условиях и достаточно полно. С учетом этих требований легко себе представить, что химия защитных групп — важный раздел органической химии. Это замечание справедливо не только для синтеза пептидов, но вообще для синтеза любых сложных органических молекул, например синтеза полинуклеотидов (разд. 3.6), строение которых предполагает возможность протекания побочных реакций по нескольким реакционноспособным центрам. [c.68]

Полинуклеотиды, подобно их мономерным единицам, поглощают ультрафиолетовое излучение. Для них характерно явление гипохромизма раствор полинуклеотида имеет меньщую оптическую плотность, чем эквимолярный раствор мономерных единиц. [c.116]

Двухцепочечные полинуклеотиды --- обладают еще меньшим поглощением, чем одноцепочечные. Это явление просто отражает тот факт, что, чем более упорядоченно расположены основания в растворе (т. е. чем в большей степени они способны участвовать [c.116]

Химический синтез полинуклеотидов [c.153]

Нуклеиновые кислоты (полинуклеотиды) [c.1049]

Наиболее широко МКД используется для исследования неорганических и комплексных соединений, включающих основания нуклеиновых кислот и полинуклеотиды. Так, в электронном спектре металлопорфиринов, имеющих симметрию 04н, наблюдаются две полосы (рис. Х1У.8). Оба возбужденных состояния дважды вырождены. Из кривой МКД видно, что коэффициент А первого перехода во много раз больше второго. Для различных металлов это соотношение составляет в среднем 9 1. Значение В коэффициента существенно зависит от заместителей в кольцах. МКД очень чувствителен к степени окисления железосодержащих порфиринов. [c.260]

Типичным примером жидкости, для которой структурные особенности выступают на передний план, является жидкая вода. Сейчас предложено множество моделей структуры жидкой воды, начиная с простейших ассоциатов, льдоподобной модели и кончая образованиями, характерными для полипептидов и полинуклеотидов бесконечно н беспорядочно разветвленный гель с быстро возникающими и исчезающими водородными связями. Выбор определенной модели жидкой воды зависит от изучаемых свойств. [c.136]

Чтобы ответить на этот вопрос, адепты биохимических теорий биогенеза обычно принимают за наиболее высокоорганизованные соединения те, которые входят а состав живых организмов сахара и другие углеводы, жиры, аминокислоты, пептиды, полинуклеотиды, ферменты и т. д. На основании выделения таких соединений в качестве высокоорганизованных они строят варианты химической эволюции , представляя ее как последовательность возможных реакций синтеза. Сахара образуются из простейших соединений [c.188]

К настоящему времени генетический код расшифрован по всем данным он универсален одни и те же основания кодируют определенную аминокислоту в организмах животных, растений и даже в бактериях. X. Корана с сотрудниками в большой серии работ синтезировали полинуклеотиды с заданной последовательностью нуклеотидов (модели ДНК). На этих полинуклеотидах удалось синтезировать модели м-РНК и на них уже, как на матрицах, были получены полипептиды в бесклеточной среде. Эти выдающиеся исследования окончательно подтвердили правильность генетического кода. [c.394]

Объясните структурные особенности полинуклеотидов. [c.432]

На рис. 3.13 представлена шкала величин бЛад, представляющих собой разность между А и Л д, где А — экспериментальное значение для полинуклеотида, Лид — значение А полностью [c.61]

Наличие дополнительного воздействия на воду со стороны двойной спирали, по сравнению с суммой воздействий отдельных атомных групп, должно давать положительные значения бЛад [149]. Если при образовании спирали изменение гидратации определяется лишь уменьшением доступности для воды атомных групп полинуклеотида, то бЛад должна быть отрицательна. Для всех исследованных спиральных структур, существенно различающихся между собой, бЛад<0 (см. рис. 3.13). По абсолютной величине значения бЛад вполне соответствуют тем, которые следует ожидать, если все гидратационные изменения при образовании спирали обусловлены только уменьшением доступности для воды атомных групп полинуклеотида [149]. Поэтому в случае нуклеиновых кислот имеющиеся экспериментальные данные свидетельствуют об отсутствии значительного дополнительного воздействия на воду со стороны регулярных спиральных структур, охватывающих значительные объемы вокруг макромолекулы. [c.62]

Хотя тРНК содержит значительное количество двуспиральных участков, структура ее существенно отличается от структуры двуспиральной ДНК или гибрида ДНК — РНК. Молекулярная масса тРНК, ( 25 ООО) значительно ниже, чем у других полинуклеотидов она обладает структурой клеверного листа [20], содержащей в заметной доле одноцепочечные участки. Четыре руки молекулы образуют два двуспиральных участка, направленных друг к другу под углом 90°, а трехмерная структура по форме напоминает букву L [21]. [c.116]

После завершения реакции защитные группы можно удалить в мягких условиях, не затрагивающих фосфодиэфирной связи. На этом основан фосфодиэфирный метод синтеза полинуклеотидов. Продукт реакции — фосфодиэфир со свободной, потенциально уязвимой для воздействия, отрицательно заряженной группой. Далее, с увеличением длины полинуклеотидной цепи число отрицательных зарядов в соединении также будет увеличиваться. Поэтому в зависимости от условий реакции эти потенциально нуклеофильные центры могут участвовать в нежелательных побочных реакциях. Кроме того, такое многозарядное соединение слищком полярно, чтобы можно было проводить его очистку обычными методами органической химии, например с помощью хроматографии на силикагеле. Вместо этого необходимо использовать хроматографию на ионообменных носителях, обладающих меньшей емкостью (например, на ДЭАЭ-целлюлозе). Фосфодиэфирный метод пригоден для получения веществ лишь в небольших количествах. Однако нейтрализация зарядов путем этерифи-кации подходящими защитными группами перед фосфорилирова-нием нуклеозидов устраняет проблемы, упомянутые выше. В этом случае продуктом реакции конденсации является фосфотриэфир. Фосфотриэфирный метод позволяет работать с большими количествами веществ. Ниже описаны некоторые защитные группы, используемые для блокирования фосфата. [c.167]

В общем пребиотическая конденсация небольших молекул, таких, как К Н,, Н2О, НСЫ, НСНО и НС = С—СК, приводила к образованию строительных блоков для синтеза полиаминокислот, или белков, а также полинуклеотидов, или нуклеиновых кислот. Оргел считает, что современное состоянис живых о паниз-мов определено непрерывностью процесса синтеза блоков, который проходил на первобытной Земле. Ему удалось показать, что полифосфаты, необходимые для синтеза полинуклеотидов, могут образоваться ири простом нагревании ортофосфатов с мочевиной и ионами аммония [44]. С помощью современных радиотелескопов большинство этих небольших молекул обнаружено также в межзвездных облаках, что делает такне предположения более вероятными. [c.185]

Лишь недавно предложена [50] биоорганическая модель, которая может объяснить код , описывающий специфическое взаимодействие полинуклеотидов и белков. При этом постулировано существование примитивного гибридного полимера, пли сополимера, содержащего рибонуклеиновую цепь (РНК), в 2 -поло-жениях которой ковалентно присоединены аминокислотные остатки. Матрица , организованная таким образом, могла бы отвечать за специфическое полипеитид-нолинуклеотидное узнавание, положившее начало современному генетическому коду. [c.185]

Наконец, можно задать вопрос почему рибоза — единственный сахар, присутствующий в полинуклеотидах Нп один другой сахар не способен к столь эффективной реакции конденсации соответствующих нуклеотидов, а З -дезокси-нуклеотиды не полимеризуются. Видимо, и 2 -0Н, и З -ОН необходимы для протекания полимеризации. Причина этого заключается в образовании водородной связи между обеими группами, которые только в рибонуклеотидах находятся в ijti -положеиии, чю приводит к повышению кислотности R0—ОН-группы в 2 -положенпи. Еще один важный факт состоит в том, что конденсация полинуклеотидов очень специфична для 1уклеотидов, рибозные остатки которых имеют D-конфигурацию. Оргел показал это эксперимен-O Og тально. Если смесь L- и D-рибояуклеотидов добавить [c.188]

Рис. 25.17. Структура полинуклеотида. Символ В обозначает любое из четырех оснований, показанных на рис. 25.15. Поскольку остаток сахара в каждом нуклеотиде представляет собой дезок-сирибозу, изображенный здесь полинуклеотид принадлежит к той форме, которая встречается в ДНК.

Нуклеиновые кислоты (полинуклеотиды). Нуклеиновые кислоты представляют собой высокомолекулярные соединения, построенные из большого числа мононуклеотидных остатков. Об этом свидетельствуют, например, их физические свойства, совпадающие со свойствами коллоидных веществ. [c.1048]

По-видимому, рибонуклеиновые кислоты также состоят из длинных винтообразных цепей полинуклеотидов. При помощи бактериальных энзимов удалось синтезировать из нуклеотидов высокомолекулярные нуклеиновые кислоты, аналогичные рибонуклеиновой кислоте однако они оказались физиологически недеятельными (Охоа). [c.1049]

Аналогичные закономерности наблюдаются при катализированном ферментами синтезе (биосинтезе) полимеров. Мономеры в этом случае являются бифункциональными соединениями, ио вследствие высокой специфичности катализатора оказывается возможным взаимодействие лишь одной из функциональных групп мономера с определенным концом растущей полимерной цепи. Например, фермент полинуклеотид-фосфорилаза, с помощью которого происходит биосинтез полирибо-нуклео1идов из нуклеозиддифосфатов, катализирует взаимодействие концевой З -ОН группы растущей полинуклеотидной цепи с пиро-фосфатной связью в мономере [c.365]

Подобно тому, как любой полипептид образуется конденсацией аминокисло , которые связываются пептидной связью, полинуклеотиды образуются в результате реакции конденсации, при которой возникают сложноэфириые фосфатные связи. Эта реакция конденсации приводит к отщеплению молекулы воды из группы ОН фосфорной кислоты и группы ОН сахара. Образование полимерной цепи схематически изображено на рис. 25.17. Органические основания на этом рисунке для простоты обозначены латинской буквой В они могут быть представлены одинаковыми или различными основаниями. [c.461]

Хотя твердофазный синтез был первоначально разработан для пептидов и с тех пор широко использовался для этой цели, он также нашел применение для синтеза полисахаридов и полинуклеотидов. Реже эта методика применяется в реакциях, где необходимо соединить лишь две молекулы (неповторяго-щиеся синтезы), но тем не менее в литературе приводится большое число примеров (обзор см. [726]). [c.158]

В молекуле нуклеиновой кислоты все мононуклеотиды связаны в строго определенной последовательности, свойственной данному полинуклеотиду. Между нуклеотидами имеется фосфорнодиэфирная связь остаток фосфорной кислоты связан по пятому положению рибозы (или дезоксирибозы) одного мо- [c.429]

Вторичная структура ДНК представляет собой двойную спираль, состоящую из двух переплетенных по-линуклеотидных цепей. Одна цепь изогнута в виде спирали и удерживает около себя вторую полинуклеотид-ную цепь. Образовавшаяся двойная спираль закручена вокруг общей оси, и основания обеих цепей обращены внутрь спирали. Здесь адениновые остатки одной цепи за счет водородных связей связаны с тиминовы.ми остатками второй цепи, а гуаниновые — с цитозиновыми. Благодаря такому взаимодействию оснований [c.431]

Основы химии высокомолекулярных соединений (1976) -- [ c.358 ]

Органическая химия (1968) -- [ c.439 ]

Курс органической химии (1965) -- [ c.626 ]

Органический синтез. Наука и искусство (2001) -- [ c.298 , c.302 ]

Молекулярная биология. Структура и биосинтез нуклеиновых кислот (1990) -- [ c.7 , c.14 , c.19 , c.25 , c.27 , c.34 , c.47 , c.48 ]

Молекулярная биология (1990) -- [ c.7 , c.14 , c.19 , c.25 , c.27 , c.34 , c.47 , c.48 ]

Органическая химия (1979) -- [ c.660 ]

Органический синтез (2001) -- [ c.298 , c.302 ]

Биохимия (2004) -- [ c.177 ]

Большой энциклопедический словарь Химия изд.2 (1998) -- [ c.393 ]

Кристаллизация полимеров (1966) -- [ c.0 ]

Жидкостная колоночная хроматография том 3 (1978) -- [ c.3 , c.89 , c.94 ]

Биохимия растений (1966) -- [ c.478 , c.481 ]

Основы биохимии Т 1,2,3 (1985) -- [ c.948 ]

Курс органической химии (1967) -- [ c.626 ]

Возможности химии сегодня и завтра (1992) -- [ c.177 , c.178 ]

Общая микробиология (1987) -- [ c.44 , c.214 ]

Биологическая химия Издание 4 (1965) -- [ c.54 ]

Органическая химия 1971 (1971) -- [ c.443 ]

Органическая химия 1974 (1974) -- [ c.367 ]

ЭПР Свободных радикалов в радиационной химии (1972) -- [ c.311 ]

Химия полимеров (1965) -- [ c.19 ]

Химия высокомолекулярных соединений Издание 2 (1966) -- [ c.444 ]

Органическая химия Издание 6 (1972) -- [ c.367 ]

Химия нуклеозидов и нуклеотидов (1966) -- [ c.0 ]

Курс органической химии Издание 4 (1985) -- [ c.476 , c.477 ]

Курс органической и биологической химии (1952) -- [ c.333 ]

Катализ в химии и энзимологии (1972) -- [ c.292 ]

Курс органической химии (0) -- [ c.1048 ]

Начала органической химии Кн 2 Издание 2 (1974) -- [ c.673 , c.678 ]

Начала органической химии Книга 2 (1970) -- [ c.743 , c.749 ]

Перспективы развития органической химии (1959) -- [ c.0 ]

Химия биологически активных природных соединений (1970) -- [ c.383 ]

Биохимия Издание 2 (1962) -- [ c.51 ]

Молекулярная биология клетки Т.3 Изд.2 (1994) -- [ c.13 ]

Электрофорез в разделении биологических макромолекул (1982) -- [ c.0 ]

Биофизическая химия Т.1 (1984) -- [ c.170 , c.177 , c.288 , c.289 ]

Физическая Биохимия (1980) -- [ c.16 ]

Молекулярная биология клетки Т.3 Изд.2 (1994) -- [ c.13 ]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология