Нуклеотидная последовательность спектры

Полимеразная цепная реакция — один из мощнейших инструментов исследования нуклеиновых кислот, не доступный ранее. ПЦР используют для анализа индивидуальных вариаций нуклеотидных последовательностей в определенных локусах, для повышения эффективности клонирования целевых последовательностей изучаемых геномов и их прямого секвенирования, для детекции патогенных микроорганизмов и т. п. Рассмотрим примеры, демонстрирующие возможности метода ПЦР и широкий спектр решаемых с его помощью научных и практических задач. [c.51]

Один из ПЦР-тестов основан на выявлении фрагмента ДНК длиной 188 п. н., который присутствует во множестве копий в геноме Т. ruzi, но отсутствует в геномной ДНК нескольких родственных паразитов. После амплификации этот фрагмент без труда обнаруживается с помощью электрофореза в полиакриламидном геле. Незначительно варьируя методику проведения ПЦР (например, изменяя нуклеотидную последовательность праймеров), последнюю можно использовать для обнаружения широкого спектра бактерий, вирусов и паразитов. [c.190]

ВКО имеет широкий спектр хозяев (позвоночных и беспозвоночных), остается жизнеспособным в течение многих лет после лиофи-лизации (испарения воды с помощью замораживания) и не обладает онкогенными свойствами, а потому может использоваться для создания так называемых векторных вакцин. С их помощью осуществляется доставка и экспрессия в организме-хозяине клонированных генов, кодирующих антигенные белки, которые индуцируют выработку протективных антител. Геном ВКО имеет большие размеры и не содержит уникальных сайтов рестрикции, что не позволяет встраивать в него дополнительные нуклеотидные последовательности. Однако нужные гены можно вводить в геном ВКО с помощью гомологичной рекомбинации in vivo следующим образом. [c.239]

Возможности применения метода ультрафиолетовой спектроскопии для идентификации неизвестных соединений особенно хорошо выявляются при изучении нуклеотидной последовательности в молекулах тРНК [38]. В процессе исследования получали индивидуальные рибонуклеотиды и определяли, какие именно — пуриновые или пиримидиновые основания содержатся в данном продукте аденин, гуанин, цитозин, урацил или их производные (так называемые минорные основания) [39]. Ультрафиолетовые спектры поглощения З -рибонуклеотидов этих четырех оснований приведены на рис. 9.15. Наличие системы сопряженных двойных связей в этих молекулах приводит к появлению полос поглощения между 190 и 280 нм. Их спектры поглощения [c.521]

Рис. 20.12. Сравнение спонтанных и индуцированных ультрафиолетовым облучением мутационных изменений путем анализа нуклеотидной последовательности ревертантов двух атЬег-мутаятоъ фага М13. Две мутантные последовательности изображены в нижней части рисунка. В опытах использовали фаги, облученные или ультрафиолетом или гамма-лучами или не подвергавшиеся облучению. Этими фагами инфицировали облученные или необлученные бактерии. На рисунке изображены спектры замен оснований, приво-

Как превратить последовательность в вектор. Чтобы воспользоваться методами дискриминантного анализа при работе с нуклеотидными последовательностями, мы должны преобразовать каждую последовательность в точку (вектор в пространстве признаков). Ранее мы видели, что признаками могут быть нуклеотиды на определенных позициях, расстояние между блоками нуклеотидов, энергия вторичной структуры, А-Т состав и т.д. Каждый признак может принимать значение из некоторого спектра позиция (нуклеотид) на последовательности ДНК, например, обладает дискретньм спектром значений - А, С, С, Т энергия вторич- [c.134]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология