Спаривание оснований кинетика

Реассоциация двух комплементарных последовательностей ДНК происходит путем спаривания оснований-в отличие от процесса денатурации, при котором они разделяются (см. рис. 2.15). Мы уже рассмотрели многие эксперименты, в основе которых лежит использование этого метод для выделения индивидуальных последовательностей ДНК или РНК и их способности гибридизоваться со специфическим зондом. Сейчас мы увидим, что кинетика реассоциации отражает разнообразие присутствующих в клетке последовательностей, причем эта реакция может быть использована для определения количества генов и их РНК-продуктов. Такие реакции при их проведении в растворе называются гибридизацией в растворе. [c.224]

В качестве модели кинетики спаривания оснований можно рассмотреть релаксацию комплексов изолированных оснований или их производных, связанных водородными связями. Такие комплексы слишком нестабильны, чтобы можно было исследовать их водные растворы, и приходится использовать неводные растворители. Изменение доли спаренных оснований можно индуцировать, поместив образец в сильное электрическое поле (-200 ООО В см ) и наложив высокочастотное модулирующее поле. Поскольку спаривание оснований приводит к изменению дипольного момента, при изменении поля равновесие этого процесса смещается. Релаксацию можно исследовать с помощью таких методов, как метод дисперсии диэлектрической проницаемости (гл. 12). Процесс можно представить в виде схемы [c.335]

АНАЛИЗ КИНЕТИКИ СПАРИВАНИЯ ОСНОВАНИЙ В ОЛИГОНУКЛЕОТИДАХ [c.338]

Кинетические процессы в нуклеиновых кислотах определяются двумя основными видами взаимодействия — стэкингом оснований и их спариванием, т.е. теми же факторами, которые определяют структуру нуклеиновых кислот. Нередко исследование кинетики этих взаимодействий может оказаться полезным для более детального понимания процессов, происходящих в полимерах. Образование стэкинга оснований в олигонуклеотидах является внутримолекулярной реакцией, поэтому его кинетику можно исследовать только путем возмущения системы. В качестве параметра, по которому производится возмущение, естественно выбрать температуру, поскольку ее изменение, как известно, меняет долю оснований, участвующих в стэкинге. Если за время порядка микросекунд поднять температуру раствора олигонуклеотидов, будет наблюдаться разрушение стэкинга, сопровождающееся увеличением поглощения. Однако скорость изменений оказывается слишком большой для количественной регистрации, даже если использовать весьма совершенные методы изучения релаксационных процессов (см., впрочем, работу Dewey, Turner, 1979). [c.332]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология