Матрицы для секвенирования ДНК автоматическим методом

МАТРИЦЫ ДЛЯ СЕКВЕНИРОВАНИЯ ДНК АВТОМАТИЧЕСКИМ МЕТОДОМ [c.309]

Первые успехи в автоматизации секвенирования ДНК, пожалуй, можно связать с полуавтоматическими и автоматическими методами. чтения последовательности нуклеотидов с радиоавтографа секвенирующего геля или даже еще с более ранней автоматической обработкой и анализом последовательности нуклеотидов с помощью компьютеров и специализированных программ. Однако в настоящее время под автоматическим секвенированием ДНК понимается, в первую очередь, электрофоретическое разделение флуоресцентно меченных продуктов терминирующих реакций с помощью специальных приборов - автоматических секвенаторов ДНК. Другой аспект автоматизации процесса секвенирования ДНК заключается в наработке матриц для их последующего ферментативного секвенирования, а также проведении секвенирующих реакций (как в ферментативном методе, так и в методе химической деградации) с помощью лабораторных биороботов. [c.309]

При автоматическом секвенировании ДНК в качестве матриц наиболее часто применяются одно- или двуцепочечные молекулы фагов, плазмид или фагмид (кроме ПЦР-продуктов, которые представляют собой отдельный тип матриц для секвенирования). Выделение требуемого большого количества подобных образцов представляет собой некоторую проблему. Так, в работе Эперона сообщалось об изготовлении специальной установки, рассчитанной на одновременное выделение 96 таких образцов с помощью фильтрации [Ерегоп, 1986]. Выделенные таким образом одноцепочечные препараты ДНК на основе фага М13 показали высокое качество секвенирования, сравнимое с матрицами, получаемыми обычным путем с использованием того же полиэтиленгликоля в качестве осадителя фаговых частиц. Впоследствии этот метод был слегка модифицирован [Ерегоп et al., 1988]. Предложенные в этих [c.309]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология