Потенциальная яма трехмерная

В этой главе мы обсудим различные факторы, определяющие конформацию белка. Сначала мы рассмотрим особенности геометрии молекулы, например фиксированные длины связей и величины валентных углов полипептидной цепи. Затем проанализируем ограничения, налагаемые на возможные конформации стерическими факторами. Мы также рассмотрим усоверщенствованный вариант подобного анализа, основанный на использовании более реалистических потенциальных функций. В заключение мы познакомимся с другими факторами, играющими очень важную роль в формировании белковых структур. К ним относятся образование хорощо изученных водородных связей и гидрофобные взаимодействия, природа которых менее понятна. Если бы все эти факторы были достаточно хорошо изучены и существовал соответствующий математический аппарат, появилась бы возможность предсказывать, например, трёхмерную структуру белка по его аминокислотной последовательности. Эта цель еще не достигнута, но недавние успехи показывают, что ее нельзя считать нереальной. (Другие аспекты укладки белковых молекул обсуждаются в гл. 21.) [c.237]

Можно почти не сомневаться в том, что при адсорбции типа Ваи-дер-Ваальса молекулы адсорбированного газа не диссоциируют на поверхности. Возможно также, что в адсорбционном слое молекулы обладают некоторой подвижностью и способны перемещаться по поверхности. Как, однако, указывает Леннард-Джонс, это перемещение скорее состоит из ряда активированных скачков с одного места с низкой потенциальной энергией на другое (не обязательно соседнее), чем является непрерывным движением, как в трёхмерном газе (см. гл. VI, 4). Хотя подвижность в молекулярно адсорбированных слоях, ках правило, гораздо выше, чем в хемосорбиро ванных, тем не менее здесь нет принципиального различия, так как во всяком случае некоторые из хемосорбционных слоёв приобретают известную подвижность при повышении температуры. [c.335]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология