Нуклеиновые кислоты интеркаляция

Сопряжена ли интеркаляция плоских молекул в цепи нуклеиновых кислот с какой-либо биохимической функцией По-видимому, да. Например, в белках, взаимодействующих с нуклеиновыми кислотами, ароматические кольца боковых цепей аминокислот могут встраиваться между плоскостями оснований в спиральной структуре ДНК наподобие закладок внутри книги [85, 86]. Изменения в плотности супервитков, вызванные интеркаляцией или изменением ионного окружения, могут играть роль в соблюдении нужной последовательности во взаимодействии ДНК с внутриклеточными ферментными системами. [c.142]

Флюоресценция резко усиливается при интеркаляции бромистого этидия в нуклеиновую кислоту, что и используется для окрашивания ДНК и двунитевых участков РНК. Однако бромистый этидий позволяет обнаружить и прису/с(гвие однонитевых нуклеиновых кислот в геле. Это происходит за счет связывания и концентрирования красителя в результате его электростатического взаимодействия с остатками фосфорной кислоты. [c.150]

В литературе обсуждаются два возможных механизма защитного действия красителей. Один из них предполагает ингибирование фотодимеризации вследствие стерических затруднений, вызванных интеркаляцией (внедрением) молекул красителя между основаниями полинуклеотида зоз Согласно второму механизму, защитное действие красителей обусловлено миграцией энергии возбуждения с оснований ДНК на комплексно-связанные с ними молекулы красителя (с последующим высвечиванием ее в виде флуоресценции или конверсией в тепловую энергию) В этом процессе основание служит сенсибилизатором, а краситель акцептором. Ряд данных свидетельствует о возможности такой миграции энергии Миграционный механизм позволяет предполагать ингибирование не только фотодимеризации, но и других фотореакций производных оснований нуклеиновых кислот [c.688]

Аналогичные исследования иа олигонуклеотидах были выполнены для комплексов с этидием. Следить за образованием комплексов в этом случае можно по изменению флуоресценции и поглощения, а также спектров ЯМР. Результаты исследований методом ЯМР подтверждают, что и в растворе сахара принимают конформации С-3 -эндо (3 -> 5 ) С-2 -эндо, характерные для больщинства кристаллических комплексов с интеркаляцией лигандов. Полученные для растворов данные были неожиданными в одном отнощенин оказалось, что комплексы с UpA UpA, pG pG и UpG СрА значительно стабильнее, чем комплексы с соответствующими изомерами, имеющими обратные последовательности. Тот факт, что в смеси некомплементариых динуклеозидфосфатов практически отсутствуют комплексы с этидием, указывает на необходимость образования в комплексах двойной спирали. Было показано, что этидий предпочтительно связывается с двухцепочечными последовательностями пиримидин(3 -> 5 )пурин. Эта специфичность, однако, не является абсолютной, и полученные данные носят качественный характер Крайне важно тем не менее, что даже такая простая молекула, как этидий, способна узна вать некоторые специфические последовательности нуклеиновых кислот. Не удивитель но, что белки, взаимодействующие с ДНК, обладают несравненно более высокой специ фичностью, связываясь лишь со строго определенными последовательностями ДНК и РНК. Следует отметить, однако, что физическая природа специфичности взаимодействия этидия с нуклеиновыми кислотами еще не вполне ясна. [c.379]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология