Последовательность сегментов РНК вирусов гриппа нуклеотидная

Была получена полная нуклеотидная последовательность всех 8 сегментов РНК вируса гриппа А (см. табл. 2), а также 4-го, 6-го, 7-го и 8-го сегментов вируса гриппа В. Структура каждого сегмента РНК и свойства кодированных ими полипептидов рассмотрены далее. Пока нет никакой информации относительно нуклеотидной последовательности РНК вируса гриппа С. [c.42]

Была определена нуклеотидная последовательность 7-го сегмента РНК вируса гриппа В она оказалась похожей по структуре на такую же последовательность для вирусов гриппа А. 7-й сегмент РНК содержит 1191 нуклеотид, включая открытую рамку считывания из 777 нуклеотидов, кодирующих белок М1 из 248 аминокислот. Вторая кодирующая область перекрывает таковую для белка М по 86 аминокислотам в рамке считывания - -2 и может кодировать максимум 195 аминокислот, но размер белкового [c.54]

Конечные нуклеотидные последовательности индивидуальных сегментов РНК вируса гриппа представляют значительный интерес из-за их общего включения в транскрипцию, трансляцию и репликацию. Ограниченное прямое секвенирование 5 - и З -концов 8 сегментов РНК вирусов гриппа А выявило присутствие общей последовательности из 13 нуклеотидов на 5 -копце у каждого сегмента и общую последовательность из 12 нуклеотидов на З -конце каждого сегмента [64, 218, 258] (для некоторых штаммов обнаружен Ц- или У-остаток в 4-м нуклеотиде на З -конце). Кроме того, [c.37]

В середине 70-х годов было обнаружено, что геном вируса гриппа состоит из восьми отдельных сегментов РНК. Это послужило основой для многочисленных генетических исследований вируса. В отличие от изучения генетических систем других отрицательно-нитчатых вирусов, таких, как вирус везикулярного стоматита [199], у генетиков, занимающихся вирусом гриппа, почти нет проблем по установлению местоположения мутации, и в случае необходимости они могут определить точное изменение нуклеотидной последовательности [209]. Действительно, ясна линия действия по созданию сайт-специфических мутаций в отдельных генах вируса гриппа, клонированных в М13 [278], хотя есть еще проблемы с повторным введением подобных генов в систему вирус — клетка хозяина. [c.240]

Д. Синтез двунитчатой ДНК с РНК вируса гриппа, клонирова-ние и определение нуклеотидных последовательностей IV. Сегменты РНК вируса гриппа. . ...... [c.6]

Полная нуклеотидная последовательность 6-го сегмента РНК вируса гриппа А, кодирующего NA, была изучена для обоих подтипов — N1 и N2 (20, 74, 99, 164]. Изучая последовательность штамма A/PR/8/34 (N1) [74] (схему см. на рис. 6), обнаружили, что 6-й сегмент РНК содержит 1413 нуклеотидов, в том числе некодирующий 5 -участок из 20 нуклеотидов и некодирующпй З -участок из 31 нуклеотида. Одна открытая рамка считывания из 1362 нуклеотидов кодирует 453 аминокислоты, что соответствует м.м. КА- -50 087 без учета углевода. Имеется 5 сайтов возможного [c.50]

Нуклеотидная последовательность 8-го сегмента РНК вируса гриппа В представлена 1096 нуклеотидами [36]. Она также кодирует два белка — NS1 и NS2 [37] с полным структурным сходством с такими же белками вирусов гриппа А. Белок NS1 имеет 281 аминокислоту, а NS2 обладает таким же N-концом из 10 аминокислот, что и NS1 перед узлом сплайсинга в мРНК последующая трансляция идет с использованием рамки считывания -Ы. Белок NS1 вируса гриппа В имеет предположительно м.м. 32 026, но в ПААГ он мигрирует аномально с кажущейся м.м. 40000 [37, [c.57]

Была определена полная нуклеотидная последовательность клонированной в полную длину ДНК-копии сегмента 7 РНК генома, кодирующего матричный белок вируса гриппа В/Ьее/40 [83]. Был получен клон от кДНК-копий вирусной РНК и мессенджер-РНК [12]. [c.279]

После окончания кодирующих участков М1 нуклеотидная гомология между сегментами 7 вирусов гриппа А и В снижается до только 1 из 4 ожидаемых совпадений и не наблюдается никакой отчетливой аминокислотной гомологии между М2-носледо-вательностями. Карбоксильный терминал белка М1 вируса гриппа В имеет последовательность из 9 аминокислот после кодона АУГ и может быть аналогичен потенциальному пептиду, кодируемому третьей мРНК сегмента 7 вируса гриппа А, который имеет только 9 аминокислот, включая инициирующий метиониновый остаток, идентичный таковому на карбоксильном терминале белка М1. [c.280]

Как мы уже отмечали, говоря о репликации РНК вируса гриппа, механизм, переключающий транскрипцию минус-цепей на их репликацию, принципиально важен, но до сих пор плохо изучен. В разделе, посвященном вирусу гриппа, мы упоминали о том, что транскрипция сегментов РНК заканчивается на рас-стоянии> 10 нуклеотидов от конца матрицы. Поэтому в ходе репликативного синтеза ключевую роль играет антитерминация, позволяющая РНК-полимеразе копировать oligo (U)-сигнал инициации полиаденилирования и последующие нуклеотиды. Для РНК-содержащих вирусов с несегментированным негативным геном антитерминация в ходе репликативного синтеза представляет собой еще более серьезную проблему. Дело в том, что для синтеза промежуточной матрицы — позитивного антигенома — РНК-полимераза не должна обращать внимания на сигнальные последовательности на границе лидер — ген NP , а кроме того, на границе всех последующих вирусных генов (рис. 24.15). Мы уже отмечали, что эволюционная консервативность сигналов терминации транскрипции у VSV и вируса Сендай указывает на важность этих нуклеотидных последовательностей для обеих РНК-полимераз. Правда, чтобы понять механизмы взаимодействия сигнальных последовательностей с комплексом полимераз- [c.477]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология