Гипервариабельные области активного центра

Вариабельные участки (V ) — (V ) представляют собой единичные домены (рис. 117). Аминокислотные замены, обусловливающие структурные отличия, обычно группируются в нескольких так называемых гипервариабельных участках. В нативной молекуле иммуноглобулина V-области легкой и тяжелой цепи соединены так, что их гипервариабельные участки образуют единый активный центр. В настоящее время установлено, что антигенсвязывающий участок образован 20 — 30 аминокислотными остатками вариабельной части каждой цепи. [c.214]

Рентгеноструктурными исследованиями комплексов РаЬ-фраг-ментов с антигенами показано, что связывание антигена происходит в щели активного центра, образованной главным образом гипервариабельными участками L- и Н-цепей. Длина щели индуцируемых антител варьирует от 0,4—0,6 до 3,4 нм, а средние размеры области связывания для полимерных антигенов различной природы (углеводы, полиаминокислоты, полинуклеотиды) составляют (2,5—3,6)Х(1,0—1,7)Х(0,6—0,7) нм. [c.101]

Интересно допустить, что заполнение пространства между петлями гипервариабельных участков удлиненной петлей одного из них, как бы выполняющей функцию лиганда, — более частое явление, чем наличие иммуноглобулинов (антител), содержащих полость, соответствующую активному центру. С энергетических позиций наличие полости невыгодно, так как в отсутствие лиганда структура недостаточно устойчива. Заполнение полости вклинившейся в нее петлей цепи существенно повышает устойчивость всей этой области, а следовательно, энергетически выгодно. [c.100]

Активные центры, или детерминанты, которые формируются в V-областях, занимают примерно 2 % поверхности молекулы иммуноглобулина. В каждой молекуле имеются две детерминанты, относящиеся к гипервариабельным участкам Н-и L-цепей, т. е. каждая молекула иммуноглобулина может связать две молекулы антигена. Поэтому антитела являются двухвалентными. [c.152]

Область, контактнрчтощая с антигеном (паратоп, или активный, антигенсвязывающий центр), располагается на N-конце РаЬ-фрагментов она представляет собой более или менее гл ок то полость, стенки к-рой сформированы ами-нокислотньгчш остатками гипервариабельных участков легкой и тяжелой пепей. У антител, связывающих белки и полисахариды, в полость может входить до 6-7 остатков аминокислот или моносахаров. У молекул IgG, IgD, IgE и IgA (молекула IgA построена подобно молекуле IgG) 2 активные центра, j молекул IgM -10. [c.217]

Архитектура иммуноглобулина может служить основой для синтеза in vitro пептидов с заданными связывающими свойствами. Для теоретических и практических исследований может оказаться крайне полезным синтез in vitro полипептидной цепи с определенной специфичностью и сродством к данному соединению. Один из возможных путей может начаться с природной или синтетической области VlIVh без гипервариабельных петель в качестве остова. Путем включения подходящих последовательностей на место гипервариабельных сегментов можно затем сформировать специфичный центр связывания рассматриваемого лиганда без нарушения процесса свертывания и стабильности остова [498]. Пример Си —Zn -содержащей пероксид-дисмутазы [286] можно рассматривать как. природный прецедент этого метода пептидной инженерии. В этом случае геометрия координации атомов металла в активных центрах имеет очень много общего с соответствующими фрагментами кристаллических структур медь-имидазольных и цинк-имидазольных. комплексов [661]. Таким образом, обе основные особенности этогО фермента, структура иммуноглобулина и комплекс металла, могуг быть воспроизведены химиками-органиками. [c.246]

Согласно рентгеноструктурным исследованиям комплексов РаЬ-фрагментов с антигенами связывание антигена происходит в доступной растворителю щели активного центра, образованной вариабельными доменами в N-концевой части легкой и тяжелой цепей. Длина щели антител варьирует от 0,4 до 3,4 нм, а средние размеры области связывания для полимерных антигенов различной природы (углеводы, полипептиды, полинуклеотиды) составляют [(2,5—3,6) (10—17) (0,6—0,7)] нм. С антигеном частично контактируют гипервариабельные участки Н- и L-цепей, расположенные в местах изгибов полипептидной цепи, а также некоторые из аминокислотных остатков, более глубоких внутренних областей цепи (рис. 6). Особую роль в построении антигенсвязывающего центра антител играет третий гипервариабель-ный участок Н-цепи, включающий от I до 20 а. о. Длина этого участка и контактирующего с ним первого гипервариабельного участка L-цепи во многом определяют размеры активных центров антител. [c.28]

Далеко не всегда активный центр представляет собой отчетливо выраженную впадину или щель. Примером служит моноклональный белок Kol, для которого не известен специфический лиганд. Это представляется закономерным, поскольку со стороны тяжелой цепи в область молекулы, обычно занимаемо активным центром, вдается весьма длинная петля третьего гипервариабельного участка. Она длиннее на шесть остатков соответствующей петли иммуноглобулина, продуцируемого клетками миеломы М603, и на восемь остатков того же участка белка New (табл. 5). [c.98]

Как указыв лось выше, полость активного центра мышиного белка МсРС 603 больше и формируется из 35 остатков гипервариабельных областей как легк и, так и тяжелой цепи. Как видно нз рис. 8, фосфорт-холин располагается в глубокой впадине. Холиновая часть реагирует с остатками как тяжелой, так и легкой цепи, тогда как фосфат взаимодействует лишь с остатками тяжелой цепи. Так же как и в предыдущем случае, гаптен заполняет лишь часть полости активного центра. Остающаяся часть, почвидимому, способна реагировать с носителем гаптена. [c.19]

Источником разнообразия трехмерной структуры активного центра являются в основном число и природа остатков гипервариабельных петель. Наиболее выраженные изменения об стовтены множественными вставками и делениями в гипервариабельных областях [c.24]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология