Изологические связи парные взаимодействия

Пару субъединиц, которые удерживаются вместе за счет контактов типа ау и связаны осью симметрии второго порядка (рис. 4-9, А), мы буде.м называть изологическим димером. Каждая точка одной субъединицы (например, а) может быть совмещена с такой же точкой другой субъединицы при повороте вокруг оси симметрии на 180°. Точки с я с одной субъединицы (см. рис. 4-9, А) расположены точно напротив соответствующих точек другой субъединицы. В центре структуры, изображенной на рпс. 4-9, А, имеется полость, поэтому группы с я с в действительности нг соприкасаются и основной вклад в связывание между субъединицами вносят парные взаимодействия типа a между группами, удаленными от оси симметрии. Однако реальный -белковый димер может и не иметь такой лолости. Пара идентичных связей в изологи-ческом димере называется обычно одиночной изологической связью. Такого рода связь включает парные взаимодействия между комплемен-тарны.ми группами (а/) и образуется за счет наличия пар идентичных групп, расположенных вдоль оси. Изологическое связывание играет исключительно большую роль в олигомерных ферментах, причем высказывалось даже предположение, что оно возникло на самых ранних стадиях эволюции ферментов. Вполне возможно, что сначала практически никакой комплементарности между взаимодействующими субъединицами не существовало и они соединялись за счет неапецифических взаимодействий в результате контактирования двух гидрофобных участков [42], однако в дальнейшем эволюция привела к появлению более специфических парных взаимодействий. [c.279]

Изологические связи парные взаимодействия [c.279]

И ОПЯТЬ если поверхности димеров окажутся в достаточной степени комплементарными, то между ними образуются связи (Ьк на рис. 4,9, Б и Ьк и с1 пг рис. 4-9, В). Обе изображенные структуры обладают диэдрической симметрией (Оа) [43]. Из рисунков видно, что, кроме оси второго порядка, перпендикулярной плоскостям обоих колец, есть еще две оси симметрии второго лорядка. Обратите внимание, что и в этом случае взаимодействия оказываются парными, т. е.. каждая пара субъединиц связана двумя контактами типа Ьк и двумя— типа с1. Таким образом, новые контакты также являются изоло-гическими. Всего для каждой комбинации двух субъединиц имеется шесть пар контактов. На рис. 4-9, В все это видно более четко, чем на рис. 4-9, Б, поскольку в последнем случае конфигурация субъединиц в структуре более или менее близка к квадратной. Тем не менее изологические взаимодействия между левой субъединицей верхнего-кольца и правой субъединицей нижнего имеют место они могут носить чисто электростатический характер, если субъединицы находятся друг от друга на некотором расстоянии. [c.281]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология