Изологический димер

Изологические димеры могут выступать в роли субъединиц при образовании более крупных замкнутых олигомеров и спиралей, например в том случае, если изологическая пара типа изображенной на рис. 4-9, А наложится на другую аналогичную пару (рис. 4-9, и В). [c.279]

Рассмотрим теперь процесс ассоциации А с В с образованием олигомеров, для которых истинные константы связывания Ках и Квх имеют те же значения, что и для мономеров. Поскольку наиболее распространенной олигомерной формой ферментов является изологический димер [63], целесообразно более подробно проанализировать поведение именно димеров. Моно и др. подчеркивали, что оба конформера А и В (Т и R) могут ассоциировать, образуя изологические димеры, в которых сохраняемся симметрия [c.298]

На рис. 4-14 показано более детально, как связываются между собой субъединицы в димере инсулина, если смотреть на молекулу примерно вдоль оси симметрии 2-го порядка (отмеченной крестиком в центре кольца фенилаланина-25). Видно, что С-концы В-цепей вытянуты. Две антипараллельные цепи образуют р-структуру с двумя парами водородных связей. Если бы связывание было строго изологическим, эти две лары связей были бы полностью эквивалентными и располагались бы симметрично одна относительно другой. Прямая, проведенная через определенную точку на одной цепи и через ось симметрии 2-го порядка, должна была бы пройти через соответствующую точку на другой цепи. Однако, как показывает тщательный анализ, структура далеко не симметрична. [c.293]

Пару субъединиц, которые удерживаются вместе за счет контактов типа ау и связаны осью симметрии второго порядка (рис. 4-9, А), мы буде.м называть изологическим димером. Каждая точка одной субъединицы (например, а) может быть совмещена с такой же точкой другой субъединицы при повороте вокруг оси симметрии на 180°. Точки с я с одной субъединицы (см. рис. 4-9, А) расположены точно напротив соответствующих точек другой субъединицы. В центре структуры, изображенной на рпс. 4-9, А, имеется полость, поэтому группы с я с в действительности нг соприкасаются и основной вклад в связывание между субъединицами вносят парные взаимодействия типа a между группами, удаленными от оси симметрии. Однако реальный -белковый димер может и не иметь такой лолости. Пара идентичных связей в изологи-ческом димере называется обычно одиночной изологической связью. Такого рода связь включает парные взаимодействия между комплемен-тарны.ми группами (а/) и образуется за счет наличия пар идентичных групп, расположенных вдоль оси. Изологическое связывание играет исключительно большую роль в олигомерных ферментах, причем высказывалось даже предположение, что оно возникло на самых ранних стадиях эволюции ферментов. Вполне возможно, что сначала практически никакой комплементарности между взаимодействующими субъединицами не существовало и они соединялись за счет неапецифических взаимодействий в результате контактирования двух гидрофобных участков [42], однако в дальнейшем эволюция привела к появлению более специфических парных взаимодействий. [c.279]

В результате взаимо-цействия 24 субъединиц может образоваться куб, в котором через центры граней проходят 3 оси симметрии 4-го порядка, через вершины — 4 оси 3-го порядка, а через ребра — 6 осей 2-го порядка (рис. 8-17). Самой большой структурой, облагающей кубической симметрией, которз-ю мож Но построить, является икосаэдр (двадцатигранник) — симметричная фигура с 20 треугольными гранями. Для ее построения требуется шестьдесят субъединиц, которые образуют в каждой из вершин гетерологические пентамеры. Как и в случае тетраэдра, каждая грань содержит гетерологический тример, а в результате взаимодействий поперек ребер образуются изологические димеры. [c.285]

Ясно, что эти молекулы могут состыковаться , образуя изологический димер, только при условии, если они не упрутся носами друг в друга (рис. 4-12, А). Однако, несмотря на очевидные стерические препятствия, изологический димер может образоваться и в этом случае, если одна из субъединиц немного изменит свою конформацию (рис. 4-12, Б). В такой структуре субъединицы будут не эквивалентными, а квазиэквивалентньши. [c.291]

И ОПЯТЬ если поверхности димеров окажутся в достаточной степени комплементарными, то между ними образуются связи (Ьк на рис. 4,9, Б и Ьк и с1 пг рис. 4-9, В). Обе изображенные структуры обладают диэдрической симметрией (Оа) [43]. Из рисунков видно, что, кроме оси второго порядка, перпендикулярной плоскостям обоих колец, есть еще две оси симметрии второго лорядка. Обратите внимание, что и в этом случае взаимодействия оказываются парными, т. е.. каждая пара субъединиц связана двумя контактами типа Ьк и двумя— типа с1. Таким образом, новые контакты также являются изоло-гическими. Всего для каждой комбинации двух субъединиц имеется шесть пар контактов. На рис. 4-9, В все это видно более четко, чем на рис. 4-9, Б, поскольку в последнем случае конфигурация субъединиц в структуре более или менее близка к квадратной. Тем не менее изологические взаимодействия между левой субъединицей верхнего-кольца и правой субъединицей нижнего имеют место они могут носить чисто электростатический характер, если субъединицы находятся друг от друга на некотором расстоянии. [c.281]

Изологические связи могут образовываться и в спиралях. Мономеры актина формируют как цепи, так и димеры. Таким образом, субъединицы в структуре, приведенной на рис. 4-7, могут быть составлены из изологическнх димеров, образованных парами, расположенными по разные стороны оси. Возможно, теперь читателю интересно самостоятельно рассмотреть вопрос о том, могут ли бактериальные жгутики состоять из изологическнх димеров. [c.284]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология