Связывание, центры между субъединицами

Рис. 9-19. Схематическая модель взаимодействия между субъединицами аллостерического фермента. У многих аллостерических ферментов центр связывания субстрата и центр связывания модулятора расположены в разных субъединицах-соответственно каталитической (С) и регуляторной (К). Сообщение о присоединении положительного модулятора М к его специфическому центру в регуляторной субъединице передастся посредством конформационных изменений каталитической субъединице, которая становится активной и ее сродство к связывающемуся с ней субстрату 8 новыщается. После отделения модулятора М от регуляторной субъединицы фермент вновь переходит в неактивную или менее активную форму.

Ферменты часто проявляют ингибирующее или активирующее влияние в присутствии физиологических концентраций метаболитов, которые являются предшественниками или продуктами метаболического пути, включающего данный фермент. Регулирование ферментативной активности по такому механизму обеспечивает поддержание концентраций метаболитов на физиологическом уровне. Такой контроль ферментативной активности может осуществляться изменениями конформации фермента, вызываемыми активаторами, ингибиторами или субстратами, и часто включает взаимодействия между субъединицами фермента. Особенно важными аспектами этой проблемы являются 1) кооперативная природа таких взаимодействий и 2) контроль ферментативной активности посредством связывания молекулы с центром, отличающимся от активного центра. Изменения ферментативной активности, которые попадают в эту категорию, часто называют аллостерическими эффектами, однако использование этого термина, к сожалению, не ограничивается этим единственным смыслом. [c.250]

Кооперативный эффект связывания кислорода гемоглобином имеет структурную природу и может быть объяснен на основе данных конфор-мационного анализа. В геме гемоглобина за счет стерического отталкивания, возникающего между проксимальным остатком гистидина и атомами азота пиррольных колец порфиринового цикла, аксиальный лиганд вытягивает ион Ре " из плоскости порфиринового макроцикла на 0,75 А. При взаимодействии с кислородом ион Ре " возвращается в плоскость порфирина (рис. 5.10). При этом высокоспиновое пирамидальное состояние координационного узла гема переходит в октаэдрическое искаженное состояние. Дистальный остаток гистидина не взаимодействует с молекулой О2, но обеспечивает оптимальные условия для ее эффективного связывания. Одновременно с ионом железа происходит перемещение остатка проксимального гистидина, что, в свою очередь, вызывает конформационные изменения белка данной субъединицы и полипептидных цепей остальных субъединиц гемоглобина. В результате этого после присоединения первой молекулы О2 к субъединице гемоглобина активные центры — гемы выходят из глобул наружу, благодаря чему [c.213]

В основе модели Моно и др. [121] лежат такие предположения белки являются олигомерами молекула белка находится в одном из двух состояний — Т (напряженном) и R (расслабленном). Формы белка находятся в равновесии, причем состояния R и Т различаются энергетически и по числу связей между субъединицами форма Т обладает большим сродством к ингибиторам, а R — к активаторам в каждом состоянии все центры связывания эквивалентны и имеют одинаковые константы связывания лигандов (принцип симметрии). [c.105]

Совокупность экспериментальных данных, теоретический анализ, аналогии с гемоглобином привели к построению модели, объясняющей механизм регуляции активности ферментов следующим образом. Молекула фермента состоит из нескольких одинаковых субъединиц, в каждой содержится один специфический центр для связывания различных типов молекул (частиц субстрата или химических регуляторов). Молекула белка, состоящая из определенного ограниченного числа единиц, всегда имеет ось симметрии. Полагают, что молекула фермента может быть в двух состояниях, сохраняя при каждом из них свою симметрию. Эти два состояния различаются по энергии связей между субъединицами в менее напряженном состоянии молекула фермента избирательно присоединяет активатор и субстрат, в более напряженном — ингибитор. Соединяясь с ферментом, данная разновидность молекул — субстрат, активатор или ингибитор — будет усиливать дальнейшее связывание молекул своей категории. При изменении относительных концентраций молекул субстрата или регуляторов равновесие может сдвигаться в ту или другую сторону. Так осуществляется взаимодействие (противоположно направленное или кооперативное) центров связывания в ферментной частице фермент реализует действие различных сигналов, переходя в одно из двух возможных равновесных состояний. [c.92]

Наглядно представить себе, как эти субъединицы могут быть связаны между собой, помогает модель (рис. 165). В настоящее время нет единого мнения относительно того, находятся ли центры связывания на малых субъединицах или же, как это показано на нашей модели, в их формировании участвуют и малая и большая субъединицы. Так или иначе, решающую [c.338]

Область контакта между субъединицами в димере фосфорилазы занимает не более 10% всей поверхности глобулы, что облегчает ее внутримолекулярную подвижность. Места связывания эффекторов и каталитический центр находятся далеко друг от друга. Так, фосфат-серин и участок связывания АМФ разделены на расстояние 15 А, а расстояние от них до ближайшего каталического центра превышает 30 А. Между каталитическими центрами на субъединицах расстояние составляет не менее 60 А. Тем не менее, присоединение лиганда к любому из этих мест влияет на состояние всех остальных. [c.260]

НАД-зависимые дегидрогеназы представляют собой довольно обширный класс ферментов, важной особенностью строения которых является наличие четвертичной структуры. Нативная молекула НАД-зависимых дегидрогеназ состоит из нескольких (от двух до восьми) идентичных субъединиц, причем каждая из них формирует свой собственный активный центр. При исследовании таких ферментов.возникает естественный вопрос — зачем же нужна олигомерная структура, если активный центр образуется без ее участия Одна из функций четвертичной структуры — стабилизация белковой глобулы за счет образования общего гидрофобного яд ра — была известна достаточно давно и не вызывала сомнений (например [1]). В отношении же роли ассоциации субъединиц в катализе и регуляции ферментативной активности долгое время сохранялись весьма неопределенные представления. С одной стороны, в каждой субъединице олигомера дегидрогеназ были все предпосылки для осуществления каталитического акта, а с другой — при проведении опытов в растворе накапливалось все большее количество данных об отсутствии активности у мономерных форм и о необходимости их ассоциации для появления активной молекулы фермента [2, 3]. Эти данные, а также факт существования кооперативных взаимодействий между субъединицами (что характерно для большинства дегидрогеназ) позволили ряду исследователей предложить следующую концепцию катализ возможен только при объединении нескольких субъединиц, поскольку для полного протекания реакции в активном центре одной субъединицы необходимы определенные изменения в сопряженном с ним активном центре другой субъединицы. Например, в случае глицеральдегид-З-фосфатдегидрогеназы (КФ 1.2.1.12) фосфоролиз ацилфермента с образованием продукта реакции (а возможно, и отщепление НАДН) в активном центре одной субъединицы происходит только при связывании субстрата в соседней субъединице [c.80]

На рис. 4-14 показано более детально, как связываются между собой субъединицы в димере инсулина, если смотреть на молекулу примерно вдоль оси симметрии 2-го порядка (отмеченной крестиком в центре кольца фенилаланина-25). Видно, что С-концы В-цепей вытянуты. Две антипараллельные цепи образуют р-структуру с двумя парами водородных связей. Если бы связывание было строго изологическим, эти две лары связей были бы полностью эквивалентными и располагались бы симметрично одна относительно другой. Прямая, проведенная через определенную точку на одной цепи и через ось симметрии 2-го порядка, должна была бы пройти через соответствующую точку на другой цепи. Однако, как показывает тщательный анализ, структура далеко не симметрична. [c.293]

Максимальное число центров связывания, найденное для иммобилизованного гаптоглобина, согласуется с известным значением— четыре центра на 1 молекулу гаптоглобина в растворе. Следовательно, гаптоглобин, присоединенный к агарозе, в целом обладает теми же свойства.ми по связыванию гемоглобина и его а- и 3-цепей, что и в растворе, и вследствие этого пригоден для детального исследования механизма взаимодействия между гаптоглобином и гемоглобином или его субъединицами. [c.374]

Сигмоидная форма кривой указывает на то, что фермент построен из субъединиц, между которыми существуют кооперативные взаимодей-ст]вия. Очевидно, связывание субстрата с каталитическим центром одной из субъединиц фермента повышает сродство к субстрату других участков связывания в той же молекуле. Регуляторные ферменты состоят из двух или более, чаще всего из четырех, субъединиц. [c.487]

Очевидно, для установления зависимости между изменениями длин связей Fe — лиганд и кооперативными структурными событиями в определенной последовательности их протекания необходимо оценить стереохимические изменения координационного центра и его окружения относительно набора фиксированных координатных осей. В настоящее время невозможно точно определить последовательность кооперативных структурных событий, начинающихся с уменьшения радиуса катиона Fe(Il) при связывании кислорода и завершающихся изменением поверхностных контактов боковых цепей аминокислот i —Рз-субъединиц [99, 103], однако можно предположить вероятный механизм, по которому изменение ионного радиуса железа сказывается на структуре более отдаленных областей белка. [c.52]

Рис. 3-49 Водородное связывание между САР-белком и его лигандом, сАМР, выявленное с помощью рентгеноструктурного анализа комплекса Показано, что две идентичные субъединицы димера объединяются с образованием центра связывания (см. также рис. 3-40). (С любезного

Fl имеет, по крайней мере, 3 участка связывания нуклеотидов, которые принадлежат -субъединице или расположены погранично между а и . В дополнение к ним чаще всего обнаруживается центр для связывания нуклеотидов, причем степень прочности связи может варьировать в соответствии с филогенетическим положением объекта. Эти участки также расположены на стыке а-и -субъединиц. В препаратах Fi из сердца быка обнаруживаются [c.116]

Дисульфидные мостики — это основной тип ковалентной связи в белках, соединяющей между собой отдельные участки полипептидной цепи или различные цепи. Внутрицепочечные дисульфидные связи участвуют в поддержании конформационной стабильности свернутой полипептидной цепи, способствуя тем самым правильной ориентации аминокислотных остатков, образующих активные центры или участки связывания ферментов, антител и других биологически активных белков. Межцепочечные дисульфидные связи соединяют между собой отдельные субъединицы или цепи, закрепляют правильную укладку полипептидных цепей в доменах, удерживаемую в противном случае лишь благодаря нековалентным взаимодействиям, и тем самым принимают участие в поддержании четвертичной структуры. [c.165]

Прежде чем приступить к рассмотрению предложенных моделей кооперативности, полезно обратить внимание на значительные различия в структуре миоглобина и гемоглобина. Миоглобин — мономерный белок, молекула которого состоит из единственной полипептидной цепи и содержит один центр, связывающий кислород. Гемоглобин же — тетрамерный белок, его молекула состоит из четырех полипептидных цепей Гили субъединиц), и каждая из них имеет центр, связывающий кислород. Молекула гемоглобина образована субъединицами двух типов (две а-субъединицы и две Р-субъединицы), однако они сходны по структуре как между собой, так и с миоглобином, поэтому в первом приближении гемоглобин можно рассматривать как тетрамер, составленный из четырех молекул миоглобина. Ретроспективное рассмотрение показывает, что различия двух белков в отношении связывания кислорода [c.167]

О чувствительно как к связыванию кофермента в активном центре той же субъединицы, так и к состоянию активного центра субъединицы, свободной от аурамина О. Таким образом, два последних варианта указывают на передачу сигнала между активным центром одной субъединицы молекулы ЛДГ и катионсвязывающим участком другой. [c.350]

Пару субъединиц, которые удерживаются вместе за счет контактов типа ау и связаны осью симметрии второго порядка (рис. 4-9, А), мы буде.м называть изологическим димером. Каждая точка одной субъединицы (например, а) может быть совмещена с такой же точкой другой субъединицы при повороте вокруг оси симметрии на 180°. Точки с я с одной субъединицы (см. рис. 4-9, А) расположены точно напротив соответствующих точек другой субъединицы. В центре структуры, изображенной на рпс. 4-9, А, имеется полость, поэтому группы с я с в действительности нг соприкасаются и основной вклад в связывание между субъединицами вносят парные взаимодействия типа a между группами, удаленными от оси симметрии. Однако реальный -белковый димер может и не иметь такой лолости. Пара идентичных связей в изологи-ческом димере называется обычно одиночной изологической связью. Такого рода связь включает парные взаимодействия между комплемен-тарны.ми группами (а/) и образуется за счет наличия пар идентичных групп, расположенных вдоль оси. Изологическое связывание играет исключительно большую роль в олигомерных ферментах, причем высказывалось даже предположение, что оно возникло на самых ранних стадиях эволюции ферментов. Вполне возможно, что сначала практически никакой комплементарности между взаимодействующими субъединицами не существовало и они соединялись за счет неапецифических взаимодействий в результате контактирования двух гидрофобных участков [42], однако в дальнейшем эволюция привела к появлению более специфических парных взаимодействий. [c.279]

Многочисленные белки связывают ионы металлов. Некоторые из них действуют как биологические хранилища металлов, в то время как другие служат для их транспорта. Ферритин запасает железо, главным образом в печени и селезенке, в виде оксигидро-ксифосфата Fe(HI) с приблизительным составом Fe(OOH)s, FeO, РО4Н2. Это соединение образует ядро диаметром 7 нм, окруженное 24 белковыми субъединицами, давая в результате сферическую молекулу общим диаметром около 12 нм. Трансферин, с другой стороны, является белком плазмы, переносящим ионы Fe + и Си +. Имеются данные, что в состав центра связывания металла входят тирозин и гистидин. Так, в спектре поглощения белка и-меется пик при 465 нм, соответствующий переносу заряда между фенолят- и Ре +-ионами. [c.561]

В отношении субстрата, так и ингибитора, имеющих обычно совершенно различные трехмерные структуры и, таким образом, шллостеричных- [152]. Последнее непременно предполагает невозможность для ингибитора связываться в активном центре, подобно классическим (изостерическим) ингибиторам. Большое число данных, включая рентгеноструктурные, подтверждают предположение, что в регуляторных ферментах имеются отличающиеся друг от друга каталитические (субстрат-связывающие) и ал-лостерические (ингибитор-связывающие) центры. Эффект связывания ингибитора в аллостерическом центре передается через белок — посредством ряда конформационных изменений (часто путем легко регистрируемого взаимодействия между субъединицами) и в конечном счете влияет на активный центр. Таким путем не участвующие в реакции, катализируемой определенным ферментом, метаболиты могут регулировать его активность, модифицируя либо связывание субстрата, либо каталитическую функцию, либо, наконец, оба этих процесса [147, 148]. [c.538]

Обсуждение механизма действия фосфатазы до сих пор не касалось осложнения, связанного с существованием лищь одного центра прочного присоединения фосфата при участии в катализе двух ионов металла. Согласно аллоствричеокой модели [76, 77], связывание одной молекулы фосфата затрудняет связывание другой из-за возникающих дальнодействующих взаимодействий между субъединицами. Альтернативный механизм [51] объясняет это [c.643]

N-концевой (остатки 1-92), взаимодействующий с ДНК, и С-концевой домен (остатки 132-236), ответственный за контакт с С-концевым доменом второй субъединицы белка. Участок цепи с 93 по 131 остаток образует перемычку между двумя функциональными доменами, на которой расположен участок атаки протеиназы Re A. В активной форме белок с1 представляет собой димер, структура которого поддерживается нековалентными взаимодействиями между С-концевыми доменами двух субъединиц. Оба N-концевых домена связываются кооперативно с палиндромными последовательностями каждого из трех участков 0 7, 0 2 и О З. При индукции протеиназа Re A расщепляет полипептидную цепь на участке между доменами. В результате этого нарушается кооперативность связывания, что проявляется в значительном снижении сродства индивидуальных N-концевых доменов к центрам связывания в операторной области. [c.189]

Присоединение кислорода индуцирует ряд конформационных изменений в мо-лекуле ПЬ, раскрытых в работах Perutz М. Связывание кислорода с переводом иона Ре " в низкоспиновое состояние сопровождается одновременным смеш ением железа на 0,07 нм в плоскость гемовой группы. Это смеш ение передается через гистидин (Р-8), и спираль (Р) вместе с гистидином подтягивается в сторону гема к центру молекулы, выталкивая из полости остаток тирозина. Затем происходит поэтапный разрыв солевых мостиков между а-субъединицами и смеш ение субъединиц вдоль контактов а1 — Рг и аг — 1 на 0,07 нм (рис. Х.З). Расстояние между гемами а-субъединиц увеличивается с 3,49 до 3,60 нм, а между гемами р-субъединиц, наоборот, сокраш ается с 3,9 до 3,3 нм. Центральная полость при этом сжимается. Разрыв шести солевых мостиков и освобождение протонов (эффект Бора) характерны для изменений, происходяш их в ПЬ. Энергия взаимодействия между субъединицами уменьшается на 25-50 кДж/моль. Конформация самих а- и р-субъединиц также изменяется, в частности на С-концах цепи. В целом оксигенация переводит каждую из субъединиц из дезокси- и оксиконформацию. Разрыв четырех солевых мостиков из шести при оксигенации первых двух а-субъединиц способствует разрыву двух остальных мостиков и, следовательно, облегчает присоединение следуюш их молекул кислорода к остальным субъединицам, увеличивая сродство их к кислороду в несколько сотен раз. В этом и состоит кооперативный характере присоединения Ог к ПЬ, при котором начало оксигенации ПЬ облегчает связывание остальных молекул Ог. [c.259]

НИЙ Т (tense, напряженном )-состоянии, которое преобладает, когда белок не связан с лигандами, или R (relaxed, расслабленном )-состоянии. Формы белка, соответствующие разным состояниям, находятся в равновесии. Указанные состояния различаются энергетически и по числу связей между субъединицами. в. Форма белка, соответствующая Т-состоянию, обладает меньшим сродством к лигандам, г. В каждом состоянии все центры связывания эквивалентны и имеют одинаковые константы связывания лигандов (предположение симметрии). [c.256]

В этой связи необходимо отметить следующее. Возможность выявления случая реакционной способности половины связывающих центров зависит от того, известна ли концентрация центров связывания на ферменте, что в свою очередь зависит от точности определения концентрации белка и чистоты препарата. Негомогенный препарат, содержащий молекулы, обладающие разным сродством к лиганду, дает кривую связывания такого же вида, как и в случае отрицательной кооперативности, что может привести к ошибочному выводу о наличии взаимодействия между субъединицами. Еще одна ситуация, которую можно ошибочно интерпретировать как случай реакционной способности половины связывающих центров, имеет место в реакциях, катализируемых лактатдегидрогеназой, и обсуждается в гл. 12 из-за неблагоприятной константы равновесия между E.NAD+.La и E.NADH.Pyr не происходит полного накопления ферментсодержащего промежуточного соединения E.NADH.Pyr [схема (12.9)]. [c.261]

Модель Михаэлиса-Ментен оказала большое влияние на развитие энзимологии. Достоинство этой модели-в простоте и широкой применимости. Все же не все ферменты подчиняются кинетике Михаэлиса-Ментен. В первую очередь-это большая группа аллостерических ферментов, для которых зависимость скорости реакции V от концентрации субстрата [8] имеет сигмоидную форму, а не гиперболическую, как предсказывает уравнение Михаэлиса-Ментен [уравнение (15)]. Вспомним, что кривая связывания кислорода для миоглобина-гиперболическая, тогда как для гемоглобина-сигмоидная. Ситуация с ферментами совершенно аналогична. В аллостерических ферментах один активный центр в молекуле фермента оказывает влияние на другой активный центр в той же молекуле. В результате такого взаимодействия между субъединицами связывание субстрата становится кооперативньш , и кривая зависимости V от [c.118]

Таким образом, рассчитанные кривые зависимости двух типов субъединиц от концентрации НАД имеют различный характер. С ними сравнивают экспериментально полученную кривую зависимости флуоресценции связанного аурамина О от концентрации добавленного НАД. В случае ее совпадения с ходом кривой, описывающей концентрацию субъединиц, одновременно занятых аурамином О и НАД, можно заключить, что конформационные изменения белка под действием НАД, отражающиеся на свойствах аураминсвязывающих областей молекулы, локализованы внутри одной субъединицы. При несовпадении экспериментальной кривой с зависимостью, полученной для этого типа субъединиц, ее сравнивают с поведением рассчитанной кривой для субъединиц, находящихся в комплексе только с НАД. Корреляциу двух кривых в этом случае указывает на чувствительность аураминсвязывающих зон одной субъединицы к связыванию НАД в активном центре другой. Если между экспериментально полученной кривой и суммой обеих рассчитанных соответствие наилучшее, делают заключение о том, что состояние белкового окружения связанного аурамина [c.350]

Для Э. характерна доменная структтоа. В глубокой щели между малым N-концевым и большим С-концевым доменами располагается активный центр фермента. Для проявления каталитич. активности необходимы ионы Mg, причем без них фермент не только не обладает активностью, но и диссоциирует на субъединицы. Считают, что в молекуле Э. существуют 3 категории участков связывания металлов каталитический, ингибиторный и конформационный . Изменение пространств. структуры фермента при связывании Mg с конформац. участком необходимо для осуществления взаимод. фермента с субстратами и конкурентными ингибиторами. Замена [c.481]

На глобуле регуляторного фермента имеется несколько специфических сайтов взаимодействия с низкомолекулярными веществами. Такими сайтами являются активный центр, аллостерические центры, центры посадки на мембрану. У некоторых ферментов количество таких специфических сайтов к различным веществам достигает десяти. Таким ферментом является, например, глутаминсинтетаза, у которого имеется активный центр и по крайней мере восемь центров для связывания различных веществ [10]. В основном количество сайтов определенного типа равно количеству субъединиц в ферменте, а на каждой субъединице имеются все сайты специфичности. В результате мутации может измениться один из таких сайтов, и тогда фермент, состояпц й из субъединиц только такого типа, изменит свои регуляторные свойства. Такими изменениями могут быть полная или частичная утрата чувствительности к эффектору, появление более сильного сродства к тому же самому или возникновение специфичности к новому эффектору. Если в клетке присутствуют нормальный и мутантный аллели, то в ней будут находиться изоферменты как нормальные, так и с мутантными субъединицами., У гибридных изоферментов изменение активности в зависимости от концентрации эффектора будет промежуточным по сравнению с белком, составленным из одних только нормальных субъединиц, и максимально измененным для белка, составленного из субъединиц только мутантного типа. При этом закон изменения активности под действием эффектора у фермента, состоящего из мутантных субъединиц, будет определяться типом взаимодействия между специфическими центрами. [c.101]

Различные связывающие центры обычно расположены на разных субъединицах фермента, так что это взаимодействие отражает взаимодействие субъединиц. Это взаимодействие может приводить к изменениям либо в максимальной скорости, либо в связывании субстрата с ферментом, либо в том и в другом, и не всегда из кинетики реакции очевидно, какое изменение происходит. Были предложены различной сложности математические модели, объясняющие этот тип кинетического поведения [71, 72]. Однако число переменных в этих моделях так велико, что трудно или даже невозможно сделать между ними выбор из кинетики данной реакции, и механизм этих эффектов может быть более успешно понят путем изучения физических или химических свойств системы. Так, изучение физических свойств аспартаттранскарбамилазы показало, что фермент состоит из двух каталитически активных субъединиц, которые можно отделить от четырех меньших размером ингибиторных субъединиц. Ингибиторные субъединицы могут связывать молекулы ингибитора даже после того, как они отделены от каталитических субъединиц [73]. [c.250]

Трехмерные структуры субъединиц димера, не ассоциированного с лигандом, идентичны и имеют вид, схематически представленный на рис. 1.8. Каждая из них состоит из четырех а-спиралей, образующих цилиндр диаметром около 20 А и длиной более 70 A. Дисульфидсвя-занный димер принадлежит к группе симметрии Сгу При взаимодействии с лигандом и комплексообразовании симметрия нарушается. Центр связывания аспартата с рецептором находится вблизи вершины димера между контактными поверхностями субъединиц на высоте более 60 A от предполагаемой поверхности внешнего фосфолипидного слоя мембраны. В соответствии со своей симметрией димер, образованный из внеклеточных доменов двух рецепторов, имеет два лигандсвя-зывающих гидрофильных кармана. Один из них, наиболее четко проявляющийся на картах электронной плотности, показан на рис. 1.9. Он включает остаток Arg-64 и фрагмент 149-154 одной субъединицы и остатки Arg-69, Arg-71 - другой, а также молекулу кристаллизационной [c.62]

В современной литературе вопросам функционирования олигомерных ферментов уделяется большое внимание. Уже в работах Кошланда, на основе концепции конформационной подвижности белков [53], развитой в принцип индуцированного соответствия , предложена модель работы олигомерных ферментов [104]. При этом используется идея о глобальной передаче конформационных изменений путем межсубъединичных взаимодействий. Модель Кошланда и др. основана на следующих постулатах в отсутствие лиганда белок существует в одной конформации лиганд, связываясь с субъединицей белка, вызывает в ней конформационное изменение, которое может передаваться на соседнюю субъединицу. Для описания связывания необходимо вводить столько констант, сколько существует центров связывания. В некоторых случаях это усложняет интерпретацию наблюдаемых экспериментальных данных. Однако, в принципе, аксиоматика этой модели такова, что кинетика практически любых олигомерных ферментов, для которых справедливо допущение о квазиравновесном связывании субстрата , может быть описана на ее основе. В зависимости от количества субъединиц и схемы взаимодействия между ними, модель допускает спектр состояний как лишенных симметрии, так и имеющих симметрию более низкого порядка по сравнению с максимальной, наблюдаемой у свободного фермента. [c.105]

ВЫМЯ группами Туг-75 (из спирали АА ) и Val-45-соседней субъединицы. Гидроксил второго атома рибо-зы образует водородную связь с карбонилом Asn-44 основной цепи соединений субъединицы. Фосфатная группа АМР стабилизируется при взаимодействии с гуанидильной группой Arg-309 из спирали ВВ. Участок связывания аллостерического эффектора удален примерно на 3,2 нм от каталитического центра, и в настоящее время не очень понятно, как взаимодействуют между собой эти участки молекулы. Можно полагать, что перемещение спирали ВВ, обусловленное взаимодействием фосфатной группы АМР с Arg-309,. влияет на положение петли, в состав которой входят остатки Rhe-285 и Phe-286, расположенные вблизи активного центра. Изменение конформации в этом участ- [c.136]

Молекула сывороточного-IgM построена из пяти элементарных субъединиц. Они скреплены между собой дисульфидными связями и специальной полипептидной J-цепью. Следовательно, каждая молекулу IgM имеет 10 центров для связывания антигена. Именно IgM-антитела появляются первыми в ходе иммунной реакции на антиген. Этот же изотип Ig первым появляется в онтогенезе В-клеток. Рецепторы покоящихся В-лимфоцитов, как правило, представлены IgM, но не пентамерной, а мономерной формой. Рецепторные IgM очень схожи с рецепторными IgG, различия касаются лишь некоторых особенностей структуры тяжелых цепей. [c.68]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология