Кодон-антикодоновое взаимодействие в участке

Проблема специфического фактор - кодонового взаимодействия, вместо кодон-антикодонового взаимодействия, очень интересна. Поразительно, что белок тоже узнает именно триплет нуклеотидов, и узнавание имеет такую же высокую степень специфичности. Более того, при наличии супрессорной тРНК, комплементарной терминирующему кодону, аминоацил-тРНК и фактор терминации равноправно конкурируют за посадку в А-участок рибосомы. Использование различных модифицированных нуклеотидных остатков в терминирующих кодонах указывает на то, что специфичность RF в узнавании кодона очень напоминает специфичность Уотсон — Криковского спаривания оснований, включая Криковское неоднозначное спаривание ( wobble ). Безусловно, структура белкового антикодона представляет собой очень интригующую и важную задачу, в том числе для решения общих проблем белок-нуклеинового узнавания. [c.267]

Имеющиеся экспериментальные данные не позволяют окончательно решить вопрос о силах, лежащих в основе кодон-антикодонового взаимодействия. Существуют даже некоторые сомнения о том, какую роль играет образование пар G—С в стабилизации взаимодействия по сравнению с парами А—U. Параметры взаимодействия, измеренные в растворе, могут отличаться от истинных, так как структура тРНК и сам участок А играют определенную роль в создании условий для ассоциации тРНК с мРНК. [c.94]

Следовательно, можно предположить, что рибосома способна непосредственно или опосредованно осуществлять корректирующее прочитывание , различая правильные и неправильные кодон-антикодоновые пары, усиливая в результате относительно слабые первоначальные различия между разными кодон-антикодоновыми парами. Предположим теперь, что не существует специфичности при первоначальном контакте между тройным комплексом аминоацил-тРНК -EF-Tu GTP и рибосомой. При условии что любой комплекс независимо от природы входящей в его состав тРНК способен попасть в участок А, количество неправильных взаимодействий должно намного превышать количество правильных. Поэтому необходимо существование некоего механизма, ответственного за стабилизацию правильной аминоацил-тРНК, позволяющего соответствующей аминокислоте выступать в роли акцептора для присоединения полипептидной цепи в реакции транспептидации. [c.114]

Справочник химика 21

Химия и химическая технология